Protein–RNA interactions for Protein: P29033

GJB2, Gap junction beta-2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB2P29033 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
GJB2P29033 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
GJB2P29033 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
GJB2P29033 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
GJB2P29033 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
GJB2P29033 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
GJB2P29033 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
GJB2P29033 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
GJB2P29033 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
GJB2P29033 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
GJB2P29033 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
GJB2P29033 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
GJB2P29033 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
GJB2P29033 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
GJB2P29033 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
GJB2P29033 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
GJB2P29033 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
GJB2P29033 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
GJB2P29033 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
GJB2P29033 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
GJB2P29033 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
GJB2P29033 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
GJB2P29033 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
GJB2P29033 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
GJB2P29033 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
GJB2P29033 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
GJB2P29033 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
GJB2P29033 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
GJB2P29033 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
GJB2P29033 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
GJB2P29033 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
GJB2P29033 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
GJB2P29033 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
GJB2P29033 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
GJB2P29033 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
GJB2P29033 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
GJB2P29033 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
GJB2P29033 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GJB2P29033 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
GJB2P29033 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GJB2P29033 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GJB2P29033 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
GJB2P29033 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
GJB2P29033 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
GJB2P29033 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GJB2P29033 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GJB2P29033 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GJB2P29033 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GJB2P29033 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
GJB2P29033 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GJB2P29033 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GJB2P29033 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GJB2P29033 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GJB2P29033 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
GJB2P29033 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
GJB2P29033 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
GJB2P29033 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
GJB2P29033 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GJB2P29033 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
GJB2P29033 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
GJB2P29033 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GJB2P29033 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
GJB2P29033 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
GJB2P29033 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GJB2P29033 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GJB2P29033 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
GJB2P29033 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GJB2P29033 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
GJB2P29033 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GJB2P29033 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
GJB2P29033 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
GJB2P29033 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
GJB2P29033 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
GJB2P29033 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
GJB2P29033 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
GJB2P29033 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
GJB2P29033 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
GJB2P29033 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
GJB2P29033 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
GJB2P29033 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
GJB2P29033 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
GJB2P29033 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
GJB2P29033 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
GJB2P29033 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
GJB2P29033 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
GJB2P29033 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
GJB2P29033 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
GJB2P29033 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
GJB2P29033 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
GJB2P29033 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
GJB2P29033 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GJB2P29033 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
GJB2P29033 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GJB2P29033 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
GJB2P29033 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GJB2P29033 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
GJB2P29033 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
GJB2P29033 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GJB2P29033 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GJB2P29033 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms