Protein–RNA interactions for Protein: P28906

CD34, Hematopoietic progenitor cell antigen CD34, humanhuman

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD34P28906 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD34P28906 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD34P28906 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD34P28906 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD34P28906 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD34P28906 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD34P28906 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD34P28906 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD34P28906 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD34P28906 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD34P28906 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD34P28906 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD34P28906 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD34P28906 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD34P28906 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD34P28906 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD34P28906 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD34P28906 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CD34P28906 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD34P28906 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD34P28906 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD34P28906 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD34P28906 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD34P28906 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD34P28906 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD34P28906 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD34P28906 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD34P28906 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD34P28906 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD34P28906 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD34P28906 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD34P28906 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD34P28906 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD34P28906 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD34P28906 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD34P28906 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD34P28906 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD34P28906 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD34P28906 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD34P28906 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD34P28906 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD34P28906 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD34P28906 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD34P28906 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD34P28906 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD34P28906 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD34P28906 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD34P28906 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD34P28906 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD34P28906 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD34P28906 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD34P28906 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD34P28906 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD34P28906 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD34P28906 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD34P28906 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD34P28906 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD34P28906 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD34P28906 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD34P28906 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD34P28906 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD34P28906 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD34P28906 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD34P28906 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD34P28906 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD34P28906 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CD34P28906 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD34P28906 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD34P28906 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CD34P28906 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD34P28906 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD34P28906 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD34P28906 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD34P28906 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD34P28906 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD34P28906 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD34P28906 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD34P28906 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD34P28906 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD34P28906 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD34P28906 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD34P28906 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD34P28906 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD34P28906 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD34P28906 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD34P28906 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD34P28906 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD34P28906 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD34P28906 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD34P28906 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD34P28906 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD34P28906 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD34P28906 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD34P28906 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD34P28906 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD34P28906 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD34P28906 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CD34P28906 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD34P28906 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD34P28906 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms