Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PTPRMP28827 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PTPRMP28827 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PTPRMP28827 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
PTPRMP28827 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PTPRMP28827 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PTPRMP28827 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PTPRMP28827 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PTPRMP28827 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PTPRMP28827 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
PTPRMP28827 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PTPRMP28827 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PTPRMP28827 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PTPRMP28827 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PTPRMP28827 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PTPRMP28827 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PTPRMP28827 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PTPRMP28827 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PTPRMP28827 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PTPRMP28827 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PTPRMP28827 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PTPRMP28827 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PTPRMP28827 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PTPRMP28827 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
PTPRMP28827 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PTPRMP28827 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PTPRMP28827 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
PTPRMP28827 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PTPRMP28827 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PTPRMP28827 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PTPRMP28827 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PTPRMP28827 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PTPRMP28827 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PTPRMP28827 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PTPRMP28827 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PTPRMP28827 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PTPRMP28827 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PTPRMP28827 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PTPRMP28827 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PTPRMP28827 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PTPRMP28827 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
PTPRMP28827 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
PTPRMP28827 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PTPRMP28827 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PTPRMP28827 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PTPRMP28827 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PTPRMP28827 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.76
PTPRMP28827 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PTPRMP28827 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PTPRMP28827 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PTPRMP28827 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PTPRMP28827 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PTPRMP28827 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PTPRMP28827 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PTPRMP28827 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PTPRMP28827 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PTPRMP28827 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PTPRMP28827 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
PTPRMP28827 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PTPRMP28827 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PTPRMP28827 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PTPRMP28827 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
PTPRMP28827 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PTPRMP28827 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PTPRMP28827 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PTPRMP28827 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PTPRMP28827 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PTPRMP28827 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PTPRMP28827 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PTPRMP28827 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PTPRMP28827 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PTPRMP28827 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
PTPRMP28827 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PTPRMP28827 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
PTPRMP28827 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC26■■□□□ 1.75
PTPRMP28827 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
PTPRMP28827 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC26■■□□□ 1.75
PTPRMP28827 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PTPRMP28827 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PTPRMP28827 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
PTPRMP28827 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC26■■□□□ 1.75
PTPRMP28827 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC26■■□□□ 1.75
PTPRMP28827 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC26■■□□□ 1.75
PTPRMP28827 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PTPRMP28827 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
PTPRMP28827 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PTPRMP28827 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
PTPRMP28827 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
PTPRMP28827 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PTPRMP28827 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PTPRMP28827 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PTPRMP28827 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
PTPRMP28827 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PTPRMP28827 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
PTPRMP28827 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PTPRMP28827 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PTPRMP28827 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PTPRMP28827 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PTPRMP28827 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PTPRMP28827 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
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