Protein–RNA interactions for Protein: P26583

HMGB2, High mobility group protein B2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB2P26583 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HMGB2P26583 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HMGB2P26583 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HMGB2P26583 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HMGB2P26583 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HMGB2P26583 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HMGB2P26583 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HMGB2P26583 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
HMGB2P26583 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HMGB2P26583 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HMGB2P26583 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HMGB2P26583 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HMGB2P26583 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HMGB2P26583 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
HMGB2P26583 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HMGB2P26583 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HMGB2P26583 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HMGB2P26583 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HMGB2P26583 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HMGB2P26583 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HMGB2P26583 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HMGB2P26583 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HMGB2P26583 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HMGB2P26583 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HMGB2P26583 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HMGB2P26583 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HMGB2P26583 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HMGB2P26583 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
HMGB2P26583 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HMGB2P26583 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HMGB2P26583 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HMGB2P26583 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HMGB2P26583 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
HMGB2P26583 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HMGB2P26583 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HMGB2P26583 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HMGB2P26583 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HMGB2P26583 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HMGB2P26583 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HMGB2P26583 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
HMGB2P26583 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
HMGB2P26583 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HMGB2P26583 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HMGB2P26583 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HMGB2P26583 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
HMGB2P26583 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HMGB2P26583 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HMGB2P26583 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HMGB2P26583 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HMGB2P26583 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HMGB2P26583 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HMGB2P26583 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HMGB2P26583 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HMGB2P26583 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HMGB2P26583 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HMGB2P26583 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HMGB2P26583 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HMGB2P26583 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HMGB2P26583 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HMGB2P26583 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HMGB2P26583 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HMGB2P26583 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HMGB2P26583 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HMGB2P26583 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HMGB2P26583 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HMGB2P26583 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HMGB2P26583 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HMGB2P26583 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HMGB2P26583 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HMGB2P26583 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
HMGB2P26583 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HMGB2P26583 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HMGB2P26583 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HMGB2P26583 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HMGB2P26583 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HMGB2P26583 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
HMGB2P26583 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HMGB2P26583 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HMGB2P26583 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HMGB2P26583 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HMGB2P26583 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HMGB2P26583 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HMGB2P26583 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HMGB2P26583 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HMGB2P26583 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HMGB2P26583 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HMGB2P26583 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
HMGB2P26583 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HMGB2P26583 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HMGB2P26583 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HMGB2P26583 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HMGB2P26583 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HMGB2P26583 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HMGB2P26583 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HMGB2P26583 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HMGB2P26583 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HMGB2P26583 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HMGB2P26583 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HMGB2P26583 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
HMGB2P26583 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms