Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,997 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPRBP23467 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPRBP23467 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPRBP23467 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPRBP23467 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPRBP23467 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPRBP23467 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPRBP23467 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPRBP23467 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPRBP23467 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPRBP23467 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPRBP23467 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPRBP23467 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPRBP23467 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPRBP23467 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPRBP23467 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPRBP23467 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPRBP23467 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPRBP23467 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPRBP23467 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPRBP23467 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPRBP23467 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPRBP23467 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPRBP23467 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPRBP23467 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPRBP23467 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPRBP23467 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPRBP23467 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPRBP23467 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPRBP23467 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPRBP23467 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPRBP23467 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPRBP23467 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPRBP23467 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPRBP23467 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPRBP23467 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPRBP23467 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPRBP23467 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPRBP23467 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPRBP23467 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPRBP23467 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPRBP23467 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPRBP23467 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPRBP23467 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPRBP23467 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPRBP23467 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPRBP23467 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPRBP23467 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPRBP23467 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
PTPRBP23467 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
PTPRBP23467 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRBP23467 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRBP23467 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRBP23467 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRBP23467 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRBP23467 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRBP23467 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRBP23467 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRBP23467 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRBP23467 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRBP23467 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRBP23467 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRBP23467 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRBP23467 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRBP23467 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRBP23467 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRBP23467 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRBP23467 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRBP23467 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRBP23467 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRBP23467 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRBP23467 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRBP23467 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRBP23467 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRBP23467 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRBP23467 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRBP23467 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRBP23467 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRBP23467 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRBP23467 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRBP23467 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRBP23467 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRBP23467 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRBP23467 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPRBP23467 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPRBP23467 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPRBP23467 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPRBP23467 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPRBP23467 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPRBP23467 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPRBP23467 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPRBP23467 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPRBP23467 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPRBP23467 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPRBP23467 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPRBP23467 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPRBP23467 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPRBP23467 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPRBP23467 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPRBP23467 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms