Protein–RNA interactions for Protein: P20337

RAB3B, Ras-related protein Rab-3B, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3BP20337 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB3BP20337 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB3BP20337 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB3BP20337 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB3BP20337 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB3BP20337 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB3BP20337 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB3BP20337 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB3BP20337 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB3BP20337 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB3BP20337 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB3BP20337 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB3BP20337 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB3BP20337 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB3BP20337 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB3BP20337 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB3BP20337 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB3BP20337 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB3BP20337 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB3BP20337 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB3BP20337 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB3BP20337 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB3BP20337 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB3BP20337 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB3BP20337 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB3BP20337 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB3BP20337 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB3BP20337 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB3BP20337 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB3BP20337 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB3BP20337 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB3BP20337 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB3BP20337 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB3BP20337 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB3BP20337 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB3BP20337 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB3BP20337 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB3BP20337 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB3BP20337 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB3BP20337 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB3BP20337 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB3BP20337 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB3BP20337 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB3BP20337 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB3BP20337 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB3BP20337 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB3BP20337 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB3BP20337 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB3BP20337 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB3BP20337 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB3BP20337 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB3BP20337 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB3BP20337 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB3BP20337 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB3BP20337 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB3BP20337 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB3BP20337 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB3BP20337 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB3BP20337 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB3BP20337 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB3BP20337 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB3BP20337 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB3BP20337 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
RAB3BP20337 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
RAB3BP20337 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
RAB3BP20337 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB3BP20337 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB3BP20337 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB3BP20337 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB3BP20337 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB3BP20337 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB3BP20337 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB3BP20337 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB3BP20337 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB3BP20337 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB3BP20337 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB3BP20337 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB3BP20337 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB3BP20337 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB3BP20337 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB3BP20337 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB3BP20337 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB3BP20337 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB3BP20337 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB3BP20337 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB3BP20337 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB3BP20337 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB3BP20337 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB3BP20337 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB3BP20337 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB3BP20337 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB3BP20337 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB3BP20337 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB3BP20337 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB3BP20337 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB3BP20337 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB3BP20337 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB3BP20337 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB3BP20337 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB3BP20337 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms