Protein–RNA interactions for Protein: P17812

CTPS1, CTP synthase 1, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1P17812 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTPS1P17812 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTPS1P17812 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTPS1P17812 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTPS1P17812 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTPS1P17812 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CTPS1P17812 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CTPS1P17812 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CTPS1P17812 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CTPS1P17812 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CTPS1P17812 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
CTPS1P17812 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CTPS1P17812 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTPS1P17812 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTPS1P17812 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTPS1P17812 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTPS1P17812 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTPS1P17812 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CTPS1P17812 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTPS1P17812 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTPS1P17812 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTPS1P17812 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTPS1P17812 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTPS1P17812 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTPS1P17812 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTPS1P17812 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTPS1P17812 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTPS1P17812 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTPS1P17812 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTPS1P17812 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTPS1P17812 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTPS1P17812 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTPS1P17812 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTPS1P17812 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTPS1P17812 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTPS1P17812 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTPS1P17812 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTPS1P17812 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTPS1P17812 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTPS1P17812 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTPS1P17812 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTPS1P17812 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTPS1P17812 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTPS1P17812 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTPS1P17812 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTPS1P17812 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTPS1P17812 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CTPS1P17812 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTPS1P17812 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTPS1P17812 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTPS1P17812 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTPS1P17812 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTPS1P17812 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CTPS1P17812 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CTPS1P17812 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CTPS1P17812 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CTPS1P17812 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CTPS1P17812 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CTPS1P17812 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CTPS1P17812 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CTPS1P17812 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CTPS1P17812 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CTPS1P17812 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CTPS1P17812 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CTPS1P17812 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CTPS1P17812 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CTPS1P17812 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CTPS1P17812 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CTPS1P17812 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CTPS1P17812 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
CTPS1P17812 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CTPS1P17812 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CTPS1P17812 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CTPS1P17812 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
CTPS1P17812 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CTPS1P17812 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CTPS1P17812 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CTPS1P17812 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CTPS1P17812 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CTPS1P17812 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CTPS1P17812 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CTPS1P17812 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CTPS1P17812 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CTPS1P17812 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CTPS1P17812 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CTPS1P17812 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CTPS1P17812 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CTPS1P17812 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CTPS1P17812 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CTPS1P17812 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CTPS1P17812 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTPS1P17812 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTPS1P17812 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTPS1P17812 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTPS1P17812 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTPS1P17812 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTPS1P17812 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTPS1P17812 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTPS1P17812 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTPS1P17812 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms