Protein–RNA interactions for Protein: P13765

HLA-DOB, HLA class II histocompatibility antigen, DO beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DOBP13765 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HLA-DOBP13765 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HLA-DOBP13765 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HLA-DOBP13765 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HLA-DOBP13765 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HLA-DOBP13765 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HLA-DOBP13765 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HLA-DOBP13765 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HLA-DOBP13765 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HLA-DOBP13765 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HLA-DOBP13765 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
HLA-DOBP13765 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HLA-DOBP13765 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HLA-DOBP13765 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HLA-DOBP13765 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HLA-DOBP13765 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HLA-DOBP13765 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HLA-DOBP13765 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HLA-DOBP13765 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HLA-DOBP13765 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HLA-DOBP13765 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
HLA-DOBP13765 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HLA-DOBP13765 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HLA-DOBP13765 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HLA-DOBP13765 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HLA-DOBP13765 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
HLA-DOBP13765 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
HLA-DOBP13765 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HLA-DOBP13765 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HLA-DOBP13765 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HLA-DOBP13765 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HLA-DOBP13765 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
HLA-DOBP13765 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HLA-DOBP13765 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HLA-DOBP13765 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HLA-DOBP13765 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HLA-DOBP13765 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HLA-DOBP13765 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HLA-DOBP13765 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HLA-DOBP13765 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HLA-DOBP13765 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HLA-DOBP13765 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HLA-DOBP13765 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HLA-DOBP13765 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HLA-DOBP13765 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HLA-DOBP13765 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HLA-DOBP13765 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HLA-DOBP13765 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HLA-DOBP13765 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HLA-DOBP13765 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HLA-DOBP13765 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HLA-DOBP13765 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HLA-DOBP13765 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HLA-DOBP13765 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HLA-DOBP13765 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HLA-DOBP13765 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HLA-DOBP13765 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HLA-DOBP13765 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HLA-DOBP13765 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HLA-DOBP13765 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HLA-DOBP13765 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HLA-DOBP13765 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HLA-DOBP13765 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HLA-DOBP13765 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HLA-DOBP13765 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HLA-DOBP13765 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HLA-DOBP13765 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HLA-DOBP13765 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HLA-DOBP13765 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HLA-DOBP13765 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HLA-DOBP13765 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HLA-DOBP13765 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HLA-DOBP13765 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HLA-DOBP13765 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HLA-DOBP13765 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HLA-DOBP13765 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HLA-DOBP13765 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
HLA-DOBP13765 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
HLA-DOBP13765 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HLA-DOBP13765 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HLA-DOBP13765 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HLA-DOBP13765 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HLA-DOBP13765 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HLA-DOBP13765 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HLA-DOBP13765 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HLA-DOBP13765 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HLA-DOBP13765 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HLA-DOBP13765 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HLA-DOBP13765 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HLA-DOBP13765 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HLA-DOBP13765 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HLA-DOBP13765 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HLA-DOBP13765 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HLA-DOBP13765 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HLA-DOBP13765 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HLA-DOBP13765 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HLA-DOBP13765 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HLA-DOBP13765 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HLA-DOBP13765 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HLA-DOBP13765 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms