Protein–RNA interactions for Protein: P12814

ACTN1, Alpha-actinin-1, humanhuman

Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN1P12814 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ACTN1P12814 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ACTN1P12814 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ACTN1P12814 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ACTN1P12814 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ACTN1P12814 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ACTN1P12814 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ACTN1P12814 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ACTN1P12814 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ACTN1P12814 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ACTN1P12814 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ACTN1P12814 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ACTN1P12814 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ACTN1P12814 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
ACTN1P12814 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
ACTN1P12814 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ACTN1P12814 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ACTN1P12814 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
ACTN1P12814 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ACTN1P12814 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ACTN1P12814 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ACTN1P12814 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ACTN1P12814 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ACTN1P12814 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
ACTN1P12814 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ACTN1P12814 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ACTN1P12814 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ACTN1P12814 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ACTN1P12814 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ACTN1P12814 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ACTN1P12814 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ACTN1P12814 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ACTN1P12814 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ACTN1P12814 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ACTN1P12814 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ACTN1P12814 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ACTN1P12814 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ACTN1P12814 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ACTN1P12814 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ACTN1P12814 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
ACTN1P12814 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ACTN1P12814 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ACTN1P12814 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ACTN1P12814 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ACTN1P12814 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ACTN1P12814 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ACTN1P12814 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ACTN1P12814 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ACTN1P12814 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ACTN1P12814 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ACTN1P12814 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ACTN1P12814 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ACTN1P12814 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ACTN1P12814 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ACTN1P12814 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ACTN1P12814 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ACTN1P12814 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ACTN1P12814 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ACTN1P12814 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ACTN1P12814 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ACTN1P12814 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ACTN1P12814 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
ACTN1P12814 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ACTN1P12814 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ACTN1P12814 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ACTN1P12814 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ACTN1P12814 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ACTN1P12814 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
ACTN1P12814 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
ACTN1P12814 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ACTN1P12814 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
ACTN1P12814 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ACTN1P12814 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ACTN1P12814 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
ACTN1P12814 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
ACTN1P12814 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
ACTN1P12814 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ACTN1P12814 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ACTN1P12814 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ACTN1P12814 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ACTN1P12814 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ACTN1P12814 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ACTN1P12814 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ACTN1P12814 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ACTN1P12814 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ACTN1P12814 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ACTN1P12814 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ACTN1P12814 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ACTN1P12814 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ACTN1P12814 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ACTN1P12814 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ACTN1P12814 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ACTN1P12814 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ACTN1P12814 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ACTN1P12814 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ACTN1P12814 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ACTN1P12814 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ACTN1P12814 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ACTN1P12814 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ACTN1P12814 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms