Protein–RNA interactions for Protein: P12270

TPR, Nucleoprotein TPR, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRP12270 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
TPRP12270 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TPRP12270 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TPRP12270 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TPRP12270 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TPRP12270 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TPRP12270 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TPRP12270 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TPRP12270 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TPRP12270 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TPRP12270 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TPRP12270 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TPRP12270 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TPRP12270 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TPRP12270 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TPRP12270 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TPRP12270 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TPRP12270 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TPRP12270 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TPRP12270 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TPRP12270 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TPRP12270 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TPRP12270 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TPRP12270 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TPRP12270 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TPRP12270 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TPRP12270 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TPRP12270 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TPRP12270 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TPRP12270 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TPRP12270 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TPRP12270 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TPRP12270 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TPRP12270 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TPRP12270 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TPRP12270 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TPRP12270 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TPRP12270 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TPRP12270 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TPRP12270 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TPRP12270 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TPRP12270 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TPRP12270 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TPRP12270 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TPRP12270 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TPRP12270 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TPRP12270 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TPRP12270 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TPRP12270 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TPRP12270 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TPRP12270 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TPRP12270 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TPRP12270 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
TPRP12270 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
TPRP12270 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.26
TPRP12270 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
TPRP12270 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.26
TPRP12270 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.26
TPRP12270 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
TPRP12270 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
TPRP12270 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
TPRP12270 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TPRP12270 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TPRP12270 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TPRP12270 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TPRP12270 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TPRP12270 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TPRP12270 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TPRP12270 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TPRP12270 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TPRP12270 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TPRP12270 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TPRP12270 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TPRP12270 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TPRP12270 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TPRP12270 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TPRP12270 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TPRP12270 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TPRP12270 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TPRP12270 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TPRP12270 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TPRP12270 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TPRP12270 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TPRP12270 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TPRP12270 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TPRP12270 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TPRP12270 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TPRP12270 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TPRP12270 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TPRP12270 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TPRP12270 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TPRP12270 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TPRP12270 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TPRP12270 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TPRP12270 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TPRP12270 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TPRP12270 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TPRP12270 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TPRP12270 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TPRP12270 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms