Protein–RNA interactions for Protein: P11926

ODC1, Ornithine decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1P11926 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ODC1P11926 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ODC1P11926 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ODC1P11926 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
ODC1P11926 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ODC1P11926 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ODC1P11926 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ODC1P11926 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ODC1P11926 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
ODC1P11926 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ODC1P11926 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ODC1P11926 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ODC1P11926 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ODC1P11926 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ODC1P11926 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ODC1P11926 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
ODC1P11926 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ODC1P11926 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ODC1P11926 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ODC1P11926 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ODC1P11926 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ODC1P11926 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ODC1P11926 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ODC1P11926 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ODC1P11926 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ODC1P11926 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ODC1P11926 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ODC1P11926 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
ODC1P11926 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ODC1P11926 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
ODC1P11926 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
ODC1P11926 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
ODC1P11926 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ODC1P11926 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ODC1P11926 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ODC1P11926 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ODC1P11926 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ODC1P11926 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ODC1P11926 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ODC1P11926 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ODC1P11926 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ODC1P11926 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ODC1P11926 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ODC1P11926 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ODC1P11926 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ODC1P11926 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ODC1P11926 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ODC1P11926 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ODC1P11926 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ODC1P11926 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
ODC1P11926 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ODC1P11926 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ODC1P11926 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ODC1P11926 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ODC1P11926 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ODC1P11926 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
ODC1P11926 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ODC1P11926 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ODC1P11926 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ODC1P11926 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ODC1P11926 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ODC1P11926 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ODC1P11926 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ODC1P11926 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ODC1P11926 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ODC1P11926 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ODC1P11926 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ODC1P11926 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ODC1P11926 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ODC1P11926 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ODC1P11926 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ODC1P11926 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ODC1P11926 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ODC1P11926 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ODC1P11926 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ODC1P11926 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ODC1P11926 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ODC1P11926 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ODC1P11926 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ODC1P11926 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ODC1P11926 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ODC1P11926 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ODC1P11926 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ODC1P11926 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ODC1P11926 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ODC1P11926 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ODC1P11926 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ODC1P11926 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ODC1P11926 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
ODC1P11926 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ODC1P11926 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
ODC1P11926 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ODC1P11926 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ODC1P11926 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ODC1P11926 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ODC1P11926 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ODC1P11926 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ODC1P11926 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ODC1P11926 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ODC1P11926 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms