Protein–RNA interactions for Protein: P0DPA2

VSIG8, V-set and immunoglobulin domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSIG8P0DPA2 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VSIG8P0DPA2 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VSIG8P0DPA2 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VSIG8P0DPA2 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
VSIG8P0DPA2 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VSIG8P0DPA2 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
VSIG8P0DPA2 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VSIG8P0DPA2 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VSIG8P0DPA2 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VSIG8P0DPA2 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VSIG8P0DPA2 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VSIG8P0DPA2 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VSIG8P0DPA2 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VSIG8P0DPA2 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VSIG8P0DPA2 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
VSIG8P0DPA2 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VSIG8P0DPA2 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VSIG8P0DPA2 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VSIG8P0DPA2 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VSIG8P0DPA2 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VSIG8P0DPA2 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VSIG8P0DPA2 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VSIG8P0DPA2 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VSIG8P0DPA2 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VSIG8P0DPA2 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VSIG8P0DPA2 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VSIG8P0DPA2 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VSIG8P0DPA2 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VSIG8P0DPA2 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VSIG8P0DPA2 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VSIG8P0DPA2 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VSIG8P0DPA2 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VSIG8P0DPA2 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VSIG8P0DPA2 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VSIG8P0DPA2 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VSIG8P0DPA2 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VSIG8P0DPA2 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VSIG8P0DPA2 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VSIG8P0DPA2 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VSIG8P0DPA2 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
VSIG8P0DPA2 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VSIG8P0DPA2 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VSIG8P0DPA2 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VSIG8P0DPA2 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VSIG8P0DPA2 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VSIG8P0DPA2 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VSIG8P0DPA2 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VSIG8P0DPA2 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VSIG8P0DPA2 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VSIG8P0DPA2 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VSIG8P0DPA2 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VSIG8P0DPA2 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VSIG8P0DPA2 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VSIG8P0DPA2 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VSIG8P0DPA2 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VSIG8P0DPA2 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VSIG8P0DPA2 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VSIG8P0DPA2 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VSIG8P0DPA2 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VSIG8P0DPA2 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VSIG8P0DPA2 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VSIG8P0DPA2 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VSIG8P0DPA2 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VSIG8P0DPA2 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VSIG8P0DPA2 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VSIG8P0DPA2 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VSIG8P0DPA2 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VSIG8P0DPA2 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VSIG8P0DPA2 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
VSIG8P0DPA2 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VSIG8P0DPA2 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
VSIG8P0DPA2 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VSIG8P0DPA2 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VSIG8P0DPA2 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VSIG8P0DPA2 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VSIG8P0DPA2 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VSIG8P0DPA2 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VSIG8P0DPA2 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VSIG8P0DPA2 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VSIG8P0DPA2 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VSIG8P0DPA2 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VSIG8P0DPA2 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
VSIG8P0DPA2 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VSIG8P0DPA2 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VSIG8P0DPA2 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
VSIG8P0DPA2 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VSIG8P0DPA2 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VSIG8P0DPA2 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VSIG8P0DPA2 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VSIG8P0DPA2 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VSIG8P0DPA2 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VSIG8P0DPA2 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VSIG8P0DPA2 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VSIG8P0DPA2 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VSIG8P0DPA2 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VSIG8P0DPA2 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VSIG8P0DPA2 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VSIG8P0DPA2 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VSIG8P0DPA2 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VSIG8P0DPA2 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms