Protein–RNA interactions for Protein: P04183

TK1, Thymidine kinase, cytosolic, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TK1P04183 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TK1P04183 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TK1P04183 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TK1P04183 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TK1P04183 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TK1P04183 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TK1P04183 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TK1P04183 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TK1P04183 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TK1P04183 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TK1P04183 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TK1P04183 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TK1P04183 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TK1P04183 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TK1P04183 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TK1P04183 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TK1P04183 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TK1P04183 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TK1P04183 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TK1P04183 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TK1P04183 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TK1P04183 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TK1P04183 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TK1P04183 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TK1P04183 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TK1P04183 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TK1P04183 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TK1P04183 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TK1P04183 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TK1P04183 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TK1P04183 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TK1P04183 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TK1P04183 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TK1P04183 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TK1P04183 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TK1P04183 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TK1P04183 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TK1P04183 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TK1P04183 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TK1P04183 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TK1P04183 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TK1P04183 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TK1P04183 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TK1P04183 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
TK1P04183 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TK1P04183 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TK1P04183 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TK1P04183 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TK1P04183 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TK1P04183 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TK1P04183 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TK1P04183 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TK1P04183 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TK1P04183 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TK1P04183 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TK1P04183 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TK1P04183 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TK1P04183 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TK1P04183 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
TK1P04183 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TK1P04183 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
TK1P04183 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TK1P04183 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TK1P04183 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TK1P04183 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TK1P04183 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
TK1P04183 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TK1P04183 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TK1P04183 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TK1P04183 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TK1P04183 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TK1P04183 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TK1P04183 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TK1P04183 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TK1P04183 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TK1P04183 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TK1P04183 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TK1P04183 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TK1P04183 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TK1P04183 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TK1P04183 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TK1P04183 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TK1P04183 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TK1P04183 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TK1P04183 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TK1P04183 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TK1P04183 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TK1P04183 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TK1P04183 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TK1P04183 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TK1P04183 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TK1P04183 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TK1P04183 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TK1P04183 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TK1P04183 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TK1P04183 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TK1P04183 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TK1P04183 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TK1P04183 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TK1P04183 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms