Protein–RNA interactions for Protein: O75182

SIN3B, Paired amphipathic helix protein Sin3b, humanhuman

Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3BO75182 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SIN3BO75182 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SIN3BO75182 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SIN3BO75182 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SIN3BO75182 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SIN3BO75182 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SIN3BO75182 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SIN3BO75182 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SIN3BO75182 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SIN3BO75182 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SIN3BO75182 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SIN3BO75182 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SIN3BO75182 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SIN3BO75182 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SIN3BO75182 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SIN3BO75182 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SIN3BO75182 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SIN3BO75182 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SIN3BO75182 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SIN3BO75182 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SIN3BO75182 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SIN3BO75182 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SIN3BO75182 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SIN3BO75182 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SIN3BO75182 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SIN3BO75182 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SIN3BO75182 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SIN3BO75182 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SIN3BO75182 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SIN3BO75182 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SIN3BO75182 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SIN3BO75182 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SIN3BO75182 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SIN3BO75182 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SIN3BO75182 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SIN3BO75182 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SIN3BO75182 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SIN3BO75182 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SIN3BO75182 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SIN3BO75182 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SIN3BO75182 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SIN3BO75182 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SIN3BO75182 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SIN3BO75182 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SIN3BO75182 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SIN3BO75182 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SIN3BO75182 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SIN3BO75182 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SIN3BO75182 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SIN3BO75182 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SIN3BO75182 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SIN3BO75182 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SIN3BO75182 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SIN3BO75182 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SIN3BO75182 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SIN3BO75182 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SIN3BO75182 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SIN3BO75182 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SIN3BO75182 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SIN3BO75182 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SIN3BO75182 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SIN3BO75182 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SIN3BO75182 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SIN3BO75182 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SIN3BO75182 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SIN3BO75182 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SIN3BO75182 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SIN3BO75182 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SIN3BO75182 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SIN3BO75182 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SIN3BO75182 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SIN3BO75182 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SIN3BO75182 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SIN3BO75182 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SIN3BO75182 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SIN3BO75182 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SIN3BO75182 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SIN3BO75182 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SIN3BO75182 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SIN3BO75182 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SIN3BO75182 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SIN3BO75182 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SIN3BO75182 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SIN3BO75182 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SIN3BO75182 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SIN3BO75182 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SIN3BO75182 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SIN3BO75182 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SIN3BO75182 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SIN3BO75182 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SIN3BO75182 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SIN3BO75182 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SIN3BO75182 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SIN3BO75182 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SIN3BO75182 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SIN3BO75182 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SIN3BO75182 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SIN3BO75182 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SIN3BO75182 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SIN3BO75182 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.3 ms