Protein–RNA interactions for Protein: O60225

SSX5, Protein SSX5, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX5O60225 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SSX5O60225 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SSX5O60225 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SSX5O60225 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSX5O60225 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSX5O60225 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSX5O60225 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSX5O60225 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SSX5O60225 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSX5O60225 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSX5O60225 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSX5O60225 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSX5O60225 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSX5O60225 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSX5O60225 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSX5O60225 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSX5O60225 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SSX5O60225 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSX5O60225 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSX5O60225 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSX5O60225 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSX5O60225 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSX5O60225 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSX5O60225 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSX5O60225 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSX5O60225 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSX5O60225 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SSX5O60225 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSX5O60225 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSX5O60225 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSX5O60225 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSX5O60225 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSX5O60225 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSX5O60225 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSX5O60225 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSX5O60225 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSX5O60225 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSX5O60225 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSX5O60225 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSX5O60225 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSX5O60225 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSX5O60225 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSX5O60225 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SSX5O60225 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSX5O60225 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSX5O60225 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSX5O60225 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSX5O60225 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSX5O60225 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSX5O60225 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSX5O60225 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSX5O60225 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSX5O60225 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSX5O60225 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSX5O60225 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSX5O60225 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSX5O60225 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSX5O60225 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSX5O60225 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSX5O60225 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSX5O60225 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSX5O60225 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSX5O60225 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSX5O60225 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSX5O60225 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSX5O60225 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSX5O60225 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SSX5O60225 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSX5O60225 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSX5O60225 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSX5O60225 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSX5O60225 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSX5O60225 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SSX5O60225 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSX5O60225 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSX5O60225 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSX5O60225 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSX5O60225 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSX5O60225 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSX5O60225 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSX5O60225 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSX5O60225 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSX5O60225 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSX5O60225 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSX5O60225 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSX5O60225 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSX5O60225 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSX5O60225 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSX5O60225 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSX5O60225 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSX5O60225 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSX5O60225 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSX5O60225 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSX5O60225 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSX5O60225 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSX5O60225 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSX5O60225 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SSX5O60225 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSX5O60225 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSX5O60225 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms