Protein–RNA interactions for Protein: O15061

SYNM, Synemin, humanhuman

Predictions only

Length 1,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNMO15061 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SYNMO15061 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SYNMO15061 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SYNMO15061 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SYNMO15061 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SYNMO15061 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SYNMO15061 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SYNMO15061 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SYNMO15061 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SYNMO15061 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SYNMO15061 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
SYNMO15061 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SYNMO15061 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SYNMO15061 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SYNMO15061 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SYNMO15061 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SYNMO15061 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SYNMO15061 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SYNMO15061 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SYNMO15061 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SYNMO15061 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SYNMO15061 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
SYNMO15061 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SYNMO15061 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SYNMO15061 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
SYNMO15061 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SYNMO15061 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SYNMO15061 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SYNMO15061 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SYNMO15061 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SYNMO15061 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SYNMO15061 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SYNMO15061 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SYNMO15061 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SYNMO15061 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SYNMO15061 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SYNMO15061 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SYNMO15061 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SYNMO15061 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
SYNMO15061 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SYNMO15061 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SYNMO15061 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SYNMO15061 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SYNMO15061 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
SYNMO15061 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SYNMO15061 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
SYNMO15061 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SYNMO15061 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SYNMO15061 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
SYNMO15061 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SYNMO15061 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SYNMO15061 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SYNMO15061 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SYNMO15061 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SYNMO15061 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SYNMO15061 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SYNMO15061 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SYNMO15061 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SYNMO15061 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
SYNMO15061 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
SYNMO15061 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SYNMO15061 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SYNMO15061 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
SYNMO15061 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SYNMO15061 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SYNMO15061 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SYNMO15061 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SYNMO15061 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SYNMO15061 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SYNMO15061 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SYNMO15061 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SYNMO15061 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SYNMO15061 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SYNMO15061 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SYNMO15061 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SYNMO15061 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SYNMO15061 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SYNMO15061 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SYNMO15061 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
SYNMO15061 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SYNMO15061 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SYNMO15061 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SYNMO15061 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SYNMO15061 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SYNMO15061 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SYNMO15061 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
SYNMO15061 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SYNMO15061 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SYNMO15061 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SYNMO15061 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SYNMO15061 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SYNMO15061 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SYNMO15061 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SYNMO15061 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SYNMO15061 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SYNMO15061 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SYNMO15061 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SYNMO15061 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SYNMO15061 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SYNMO15061 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms