Protein–RNA interactions for Protein: O00591

GABRP, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit pi, humanhuman

Predictions only

Length 440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRPO00591 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GABRPO00591 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GABRPO00591 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GABRPO00591 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GABRPO00591 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GABRPO00591 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GABRPO00591 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
GABRPO00591 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GABRPO00591 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GABRPO00591 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GABRPO00591 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GABRPO00591 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GABRPO00591 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GABRPO00591 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GABRPO00591 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GABRPO00591 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GABRPO00591 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GABRPO00591 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GABRPO00591 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GABRPO00591 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GABRPO00591 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GABRPO00591 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GABRPO00591 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABRPO00591 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABRPO00591 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABRPO00591 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABRPO00591 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABRPO00591 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABRPO00591 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABRPO00591 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABRPO00591 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABRPO00591 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABRPO00591 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABRPO00591 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
GABRPO00591 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABRPO00591 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABRPO00591 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABRPO00591 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
GABRPO00591 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABRPO00591 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABRPO00591 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABRPO00591 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABRPO00591 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABRPO00591 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABRPO00591 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
GABRPO00591 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABRPO00591 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABRPO00591 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
GABRPO00591 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABRPO00591 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABRPO00591 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABRPO00591 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABRPO00591 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABRPO00591 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABRPO00591 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABRPO00591 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABRPO00591 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABRPO00591 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABRPO00591 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABRPO00591 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABRPO00591 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABRPO00591 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABRPO00591 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABRPO00591 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABRPO00591 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABRPO00591 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABRPO00591 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABRPO00591 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
GABRPO00591 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
GABRPO00591 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABRPO00591 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABRPO00591 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABRPO00591 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABRPO00591 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABRPO00591 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABRPO00591 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABRPO00591 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
GABRPO00591 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABRPO00591 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABRPO00591 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
GABRPO00591 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABRPO00591 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABRPO00591 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABRPO00591 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABRPO00591 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABRPO00591 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABRPO00591 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABRPO00591 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABRPO00591 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABRPO00591 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABRPO00591 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABRPO00591 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABRPO00591 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABRPO00591 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABRPO00591 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABRPO00591 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABRPO00591 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABRPO00591 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABRPO00591 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABRPO00591 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms