Protein–RNA interactions for Protein: O00217

NDUFS8, NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 8, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFS8O00217 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
NDUFS8O00217 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NDUFS8O00217 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NDUFS8O00217 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NDUFS8O00217 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NDUFS8O00217 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NDUFS8O00217 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NDUFS8O00217 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
NDUFS8O00217 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NDUFS8O00217 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NDUFS8O00217 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NDUFS8O00217 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NDUFS8O00217 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NDUFS8O00217 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NDUFS8O00217 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
NDUFS8O00217 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
NDUFS8O00217 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
NDUFS8O00217 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NDUFS8O00217 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
NDUFS8O00217 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NDUFS8O00217 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
NDUFS8O00217 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
NDUFS8O00217 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
NDUFS8O00217 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NDUFS8O00217 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
NDUFS8O00217 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NDUFS8O00217 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NDUFS8O00217 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NDUFS8O00217 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NDUFS8O00217 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NDUFS8O00217 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NDUFS8O00217 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NDUFS8O00217 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NDUFS8O00217 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NDUFS8O00217 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NDUFS8O00217 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NDUFS8O00217 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NDUFS8O00217 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NDUFS8O00217 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NDUFS8O00217 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NDUFS8O00217 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NDUFS8O00217 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NDUFS8O00217 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NDUFS8O00217 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NDUFS8O00217 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NDUFS8O00217 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NDUFS8O00217 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NDUFS8O00217 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NDUFS8O00217 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NDUFS8O00217 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NDUFS8O00217 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NDUFS8O00217 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NDUFS8O00217 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NDUFS8O00217 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NDUFS8O00217 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NDUFS8O00217 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NDUFS8O00217 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NDUFS8O00217 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NDUFS8O00217 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NDUFS8O00217 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NDUFS8O00217 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
NDUFS8O00217 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NDUFS8O00217 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
NDUFS8O00217 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NDUFS8O00217 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
NDUFS8O00217 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NDUFS8O00217 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NDUFS8O00217 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NDUFS8O00217 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NDUFS8O00217 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NDUFS8O00217 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NDUFS8O00217 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NDUFS8O00217 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NDUFS8O00217 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NDUFS8O00217 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NDUFS8O00217 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NDUFS8O00217 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NDUFS8O00217 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
NDUFS8O00217 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
NDUFS8O00217 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC14.88□□□□□ -0.03
NDUFS8O00217 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NDUFS8O00217 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
NDUFS8O00217 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NDUFS8O00217 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NDUFS8O00217 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NDUFS8O00217 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NDUFS8O00217 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NDUFS8O00217 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NDUFS8O00217 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NDUFS8O00217 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
NDUFS8O00217 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
NDUFS8O00217 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
NDUFS8O00217 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
NDUFS8O00217 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
NDUFS8O00217 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
NDUFS8O00217 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
NDUFS8O00217 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
NDUFS8O00217 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NDUFS8O00217 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
NDUFS8O00217 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms