Protein–RNA interactions for Protein: F6Z9R1

Gm20538, Predicted gene 20538 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 75 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20538F6Z9R1 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Gm20538F6Z9R1 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Gm20538F6Z9R1 Sgk2-201ENSMUST00000018012 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Gm20538F6Z9R1 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Gm20538F6Z9R1 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Gm20538F6Z9R1 Scnn1b-201ENSMUST00000033161 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Gm20538F6Z9R1 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Gm20538F6Z9R1 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Gm20538F6Z9R1 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Gm20538F6Z9R1 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Gm20538F6Z9R1 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Gm20538F6Z9R1 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Gm20538F6Z9R1 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Gm20538F6Z9R1 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Gm20538F6Z9R1 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Gm20538F6Z9R1 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Gm20538F6Z9R1 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Gm20538F6Z9R1 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Gm20538F6Z9R1 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Gm20538F6Z9R1 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
Gm20538F6Z9R1 Prr30-201ENSMUST00000057718 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
Gm20538F6Z9R1 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Gm20538F6Z9R1 Celf1-208ENSMUST00000111455 7579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Gm20538F6Z9R1 Dysf-204ENSMUST00000113821 6803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Gm20538F6Z9R1 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Gm20538F6Z9R1 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Gm20538F6Z9R1 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Gm20538F6Z9R1 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Gm20538F6Z9R1 Spg20-203ENSMUST00000117341 2957 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Gm20538F6Z9R1 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Gm20538F6Z9R1 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Gm20538F6Z9R1 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Gm20538F6Z9R1 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Gm20538F6Z9R1 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
Gm20538F6Z9R1 Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 5407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Gm20538F6Z9R1 Prf1-202ENSMUST00000219375 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Gm20538F6Z9R1 9430065F17Rik-203ENSMUST00000223845 1380 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Gm20538F6Z9R1 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Gm20538F6Z9R1 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Gm20538F6Z9R1 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Gm20538F6Z9R1 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Gm20538F6Z9R1 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Gm20538F6Z9R1 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Gm20538F6Z9R1 Bco1-202ENSMUST00000167370 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Gm20538F6Z9R1 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Gm20538F6Z9R1 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Gm20538F6Z9R1 Calr-201ENSMUST00000003912 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Gm20538F6Z9R1 Mthfsd-201ENSMUST00000047282 8312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Gm20538F6Z9R1 Aff1-202ENSMUST00000054979 8323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Gm20538F6Z9R1 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Gm20538F6Z9R1 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Gm20538F6Z9R1 Tom1l2-203ENSMUST00000093048 4864 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Gm20538F6Z9R1 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Gm20538F6Z9R1 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Gm20538F6Z9R1 Sipa1l1-210ENSMUST00000222714 6002 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Gm20538F6Z9R1 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Gm20538F6Z9R1 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Gm20538F6Z9R1 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Gm20538F6Z9R1 Samhd1-203ENSMUST00000109549 3245 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Gm20538F6Z9R1 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Gm20538F6Z9R1 Sfxn2-201ENSMUST00000026011 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Gm20538F6Z9R1 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Gm20538F6Z9R1 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Gm20538F6Z9R1 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Gm20538F6Z9R1 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Gm20538F6Z9R1 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Gm20538F6Z9R1 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Gm20538F6Z9R1 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Gm20538F6Z9R1 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Gm20538F6Z9R1 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Gm20538F6Z9R1 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Gm20538F6Z9R1 Tnfaip3-201ENSMUST00000019997 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Gm20538F6Z9R1 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Gm20538F6Z9R1 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Gm20538F6Z9R1 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Gm20538F6Z9R1 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Gm20538F6Z9R1 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Gm20538F6Z9R1 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Gm20538F6Z9R1 Armcx6-201ENSMUST00000052431 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Gm20538F6Z9R1 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Gm20538F6Z9R1 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Gm20538F6Z9R1 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Gm20538F6Z9R1 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Gm20538F6Z9R1 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Gm20538F6Z9R1 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Gm20538F6Z9R1 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Gm20538F6Z9R1 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Gm20538F6Z9R1 Nav2-204ENSMUST00000183659 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Gm20538F6Z9R1 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Gm20538F6Z9R1 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Gm20538F6Z9R1 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Gm20538F6Z9R1 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Gm20538F6Z9R1 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Gm20538F6Z9R1 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Gm20538F6Z9R1 Mcm3ap-201ENSMUST00000170795 6427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Gm20538F6Z9R1 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Gm20538F6Z9R1 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Gm20538F6Z9R1 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Gm20538F6Z9R1 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Gm20538F6Z9R1 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms