Protein–RNA interactions for Protein: E9PBE3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PBE3 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
E9PBE3 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
E9PBE3 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
E9PBE3 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
E9PBE3 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
E9PBE3 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
E9PBE3 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
E9PBE3 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
E9PBE3 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
E9PBE3 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
E9PBE3 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
E9PBE3 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
E9PBE3 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
E9PBE3 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
E9PBE3 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
E9PBE3 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
E9PBE3 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
E9PBE3 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
E9PBE3 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
E9PBE3 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
E9PBE3 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
E9PBE3 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
E9PBE3 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
E9PBE3 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
E9PBE3 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
E9PBE3 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
E9PBE3 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
E9PBE3 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
E9PBE3 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
E9PBE3 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
E9PBE3 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
E9PBE3 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
E9PBE3 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
E9PBE3 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
E9PBE3 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
E9PBE3 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
E9PBE3 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
E9PBE3 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
E9PBE3 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
E9PBE3 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
E9PBE3 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
E9PBE3 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
E9PBE3 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
E9PBE3 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
E9PBE3 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
E9PBE3 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
E9PBE3 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
E9PBE3 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
E9PBE3 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
E9PBE3 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
E9PBE3 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
E9PBE3 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
E9PBE3 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
E9PBE3 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
E9PBE3 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
E9PBE3 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
E9PBE3 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
E9PBE3 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
E9PBE3 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
E9PBE3 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
E9PBE3 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
E9PBE3 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
E9PBE3 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
E9PBE3 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
E9PBE3 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
E9PBE3 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
E9PBE3 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
E9PBE3 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
E9PBE3 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
E9PBE3 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
E9PBE3 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
E9PBE3 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.39
E9PBE3 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
E9PBE3 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
E9PBE3 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
E9PBE3 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
E9PBE3 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
E9PBE3 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
E9PBE3 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
E9PBE3 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
E9PBE3 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
E9PBE3 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
E9PBE3 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
E9PBE3 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
E9PBE3 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
E9PBE3 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
E9PBE3 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
E9PBE3 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
E9PBE3 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
E9PBE3 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
E9PBE3 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
E9PBE3 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
E9PBE3 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
E9PBE3 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
E9PBE3 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
E9PBE3 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
E9PBE3 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
E9PBE3 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
E9PBE3 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
E9PBE3 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms