Protein–RNA interactions for Protein: C9JDP6

CLDN25, Putative claudin-25, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN25C9JDP6 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLDN25C9JDP6 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLDN25C9JDP6 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLDN25C9JDP6 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLDN25C9JDP6 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLDN25C9JDP6 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLDN25C9JDP6 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLDN25C9JDP6 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLDN25C9JDP6 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLDN25C9JDP6 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLDN25C9JDP6 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLDN25C9JDP6 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLDN25C9JDP6 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLDN25C9JDP6 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLDN25C9JDP6 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CLDN25C9JDP6 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLDN25C9JDP6 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CLDN25C9JDP6 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLDN25C9JDP6 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLDN25C9JDP6 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLDN25C9JDP6 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLDN25C9JDP6 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLDN25C9JDP6 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLDN25C9JDP6 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLDN25C9JDP6 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLDN25C9JDP6 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLDN25C9JDP6 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLDN25C9JDP6 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLDN25C9JDP6 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLDN25C9JDP6 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLDN25C9JDP6 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLDN25C9JDP6 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLDN25C9JDP6 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLDN25C9JDP6 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLDN25C9JDP6 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLDN25C9JDP6 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLDN25C9JDP6 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CLDN25C9JDP6 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLDN25C9JDP6 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLDN25C9JDP6 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLDN25C9JDP6 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLDN25C9JDP6 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLDN25C9JDP6 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
CLDN25C9JDP6 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CLDN25C9JDP6 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CLDN25C9JDP6 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CLDN25C9JDP6 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CLDN25C9JDP6 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLDN25C9JDP6 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLDN25C9JDP6 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLDN25C9JDP6 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLDN25C9JDP6 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLDN25C9JDP6 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLDN25C9JDP6 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLDN25C9JDP6 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLDN25C9JDP6 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLDN25C9JDP6 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLDN25C9JDP6 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLDN25C9JDP6 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLDN25C9JDP6 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLDN25C9JDP6 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLDN25C9JDP6 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLDN25C9JDP6 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLDN25C9JDP6 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLDN25C9JDP6 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLDN25C9JDP6 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLDN25C9JDP6 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLDN25C9JDP6 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CLDN25C9JDP6 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CLDN25C9JDP6 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLDN25C9JDP6 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLDN25C9JDP6 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLDN25C9JDP6 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLDN25C9JDP6 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLDN25C9JDP6 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLDN25C9JDP6 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLDN25C9JDP6 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLDN25C9JDP6 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLDN25C9JDP6 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLDN25C9JDP6 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLDN25C9JDP6 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLDN25C9JDP6 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLDN25C9JDP6 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLDN25C9JDP6 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLDN25C9JDP6 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLDN25C9JDP6 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLDN25C9JDP6 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLDN25C9JDP6 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLDN25C9JDP6 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLDN25C9JDP6 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLDN25C9JDP6 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLDN25C9JDP6 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLDN25C9JDP6 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLDN25C9JDP6 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLDN25C9JDP6 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLDN25C9JDP6 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLDN25C9JDP6 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLDN25C9JDP6 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLDN25C9JDP6 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLDN25C9JDP6 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms