Protein–RNA interactions for Protein: A8MTQ0

NOTO, Homeobox protein notochord, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOTOA8MTQ0 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NOTOA8MTQ0 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NOTOA8MTQ0 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NOTOA8MTQ0 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NOTOA8MTQ0 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NOTOA8MTQ0 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NOTOA8MTQ0 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NOTOA8MTQ0 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NOTOA8MTQ0 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NOTOA8MTQ0 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NOTOA8MTQ0 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NOTOA8MTQ0 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NOTOA8MTQ0 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NOTOA8MTQ0 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NOTOA8MTQ0 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NOTOA8MTQ0 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NOTOA8MTQ0 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NOTOA8MTQ0 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NOTOA8MTQ0 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NOTOA8MTQ0 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NOTOA8MTQ0 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
NOTOA8MTQ0 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
NOTOA8MTQ0 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NOTOA8MTQ0 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NOTOA8MTQ0 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NOTOA8MTQ0 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NOTOA8MTQ0 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NOTOA8MTQ0 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NOTOA8MTQ0 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NOTOA8MTQ0 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
NOTOA8MTQ0 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NOTOA8MTQ0 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NOTOA8MTQ0 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NOTOA8MTQ0 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NOTOA8MTQ0 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NOTOA8MTQ0 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NOTOA8MTQ0 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NOTOA8MTQ0 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NOTOA8MTQ0 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NOTOA8MTQ0 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NOTOA8MTQ0 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NOTOA8MTQ0 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NOTOA8MTQ0 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NOTOA8MTQ0 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NOTOA8MTQ0 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NOTOA8MTQ0 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NOTOA8MTQ0 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NOTOA8MTQ0 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NOTOA8MTQ0 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NOTOA8MTQ0 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NOTOA8MTQ0 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NOTOA8MTQ0 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NOTOA8MTQ0 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NOTOA8MTQ0 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NOTOA8MTQ0 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NOTOA8MTQ0 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NOTOA8MTQ0 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NOTOA8MTQ0 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NOTOA8MTQ0 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NOTOA8MTQ0 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NOTOA8MTQ0 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NOTOA8MTQ0 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NOTOA8MTQ0 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NOTOA8MTQ0 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NOTOA8MTQ0 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NOTOA8MTQ0 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NOTOA8MTQ0 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NOTOA8MTQ0 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
NOTOA8MTQ0 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NOTOA8MTQ0 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NOTOA8MTQ0 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NOTOA8MTQ0 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NOTOA8MTQ0 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NOTOA8MTQ0 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NOTOA8MTQ0 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NOTOA8MTQ0 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NOTOA8MTQ0 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NOTOA8MTQ0 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NOTOA8MTQ0 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NOTOA8MTQ0 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NOTOA8MTQ0 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NOTOA8MTQ0 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NOTOA8MTQ0 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NOTOA8MTQ0 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NOTOA8MTQ0 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NOTOA8MTQ0 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NOTOA8MTQ0 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NOTOA8MTQ0 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NOTOA8MTQ0 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NOTOA8MTQ0 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NOTOA8MTQ0 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NOTOA8MTQ0 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NOTOA8MTQ0 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NOTOA8MTQ0 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NOTOA8MTQ0 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NOTOA8MTQ0 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NOTOA8MTQ0 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NOTOA8MTQ0 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NOTOA8MTQ0 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NOTOA8MTQ0 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms