Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y679

AUP1, Ancient ubiquitous protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AUP1Q9Y679 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
AUP1Q9Y679 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AUP1Q9Y679 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AUP1Q9Y679 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AUP1Q9Y679 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AUP1Q9Y679 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AUP1Q9Y679 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AUP1Q9Y679 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AUP1Q9Y679 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AUP1Q9Y679 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AUP1Q9Y679 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
AUP1Q9Y679 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AUP1Q9Y679 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
AUP1Q9Y679 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AUP1Q9Y679 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AUP1Q9Y679 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AUP1Q9Y679 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AUP1Q9Y679 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AUP1Q9Y679 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AUP1Q9Y679 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AUP1Q9Y679 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AUP1Q9Y679 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AUP1Q9Y679 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AUP1Q9Y679 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AUP1Q9Y679 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AUP1Q9Y679 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AUP1Q9Y679 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AUP1Q9Y679 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AUP1Q9Y679 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AUP1Q9Y679 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AUP1Q9Y679 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AUP1Q9Y679 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AUP1Q9Y679 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AUP1Q9Y679 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AUP1Q9Y679 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AUP1Q9Y679 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AUP1Q9Y679 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
AUP1Q9Y679 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AUP1Q9Y679 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AUP1Q9Y679 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AUP1Q9Y679 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AUP1Q9Y679 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AUP1Q9Y679 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AUP1Q9Y679 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AUP1Q9Y679 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AUP1Q9Y679 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AUP1Q9Y679 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AUP1Q9Y679 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AUP1Q9Y679 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AUP1Q9Y679 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AUP1Q9Y679 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AUP1Q9Y679 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AUP1Q9Y679 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
AUP1Q9Y679 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AUP1Q9Y679 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AUP1Q9Y679 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AUP1Q9Y679 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AUP1Q9Y679 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AUP1Q9Y679 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AUP1Q9Y679 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
AUP1Q9Y679 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AUP1Q9Y679 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AUP1Q9Y679 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AUP1Q9Y679 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AUP1Q9Y679 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AUP1Q9Y679 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AUP1Q9Y679 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AUP1Q9Y679 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AUP1Q9Y679 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AUP1Q9Y679 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AUP1Q9Y679 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
AUP1Q9Y679 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AUP1Q9Y679 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AUP1Q9Y679 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AUP1Q9Y679 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
AUP1Q9Y679 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
AUP1Q9Y679 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
AUP1Q9Y679 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
AUP1Q9Y679 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AUP1Q9Y679 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
AUP1Q9Y679 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
AUP1Q9Y679 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AUP1Q9Y679 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AUP1Q9Y679 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AUP1Q9Y679 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AUP1Q9Y679 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AUP1Q9Y679 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
AUP1Q9Y679 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AUP1Q9Y679 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
AUP1Q9Y679 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
AUP1Q9Y679 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AUP1Q9Y679 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
AUP1Q9Y679 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
AUP1Q9Y679 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
AUP1Q9Y679 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
AUP1Q9Y679 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
AUP1Q9Y679 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
AUP1Q9Y679 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
AUP1Q9Y679 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
AUP1Q9Y679 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms