Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT99

LRRC4B, Leucine-rich repeat-containing protein 4B, humanhuman

Predictions only

Length 713 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC4BQ9NT99 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRRC4BQ9NT99 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRRC4BQ9NT99 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRRC4BQ9NT99 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRRC4BQ9NT99 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRRC4BQ9NT99 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRRC4BQ9NT99 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRRC4BQ9NT99 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRRC4BQ9NT99 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRRC4BQ9NT99 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRRC4BQ9NT99 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRRC4BQ9NT99 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRRC4BQ9NT99 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRRC4BQ9NT99 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRRC4BQ9NT99 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRRC4BQ9NT99 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRRC4BQ9NT99 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRRC4BQ9NT99 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRRC4BQ9NT99 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRRC4BQ9NT99 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRRC4BQ9NT99 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRRC4BQ9NT99 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRRC4BQ9NT99 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRRC4BQ9NT99 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRRC4BQ9NT99 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRRC4BQ9NT99 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRRC4BQ9NT99 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRRC4BQ9NT99 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRRC4BQ9NT99 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRRC4BQ9NT99 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRRC4BQ9NT99 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRRC4BQ9NT99 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRRC4BQ9NT99 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRRC4BQ9NT99 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRRC4BQ9NT99 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRRC4BQ9NT99 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRRC4BQ9NT99 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRRC4BQ9NT99 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRRC4BQ9NT99 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRRC4BQ9NT99 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRRC4BQ9NT99 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRRC4BQ9NT99 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRRC4BQ9NT99 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRRC4BQ9NT99 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRRC4BQ9NT99 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRRC4BQ9NT99 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRRC4BQ9NT99 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRRC4BQ9NT99 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRRC4BQ9NT99 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRRC4BQ9NT99 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
LRRC4BQ9NT99 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRRC4BQ9NT99 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRRC4BQ9NT99 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRRC4BQ9NT99 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRRC4BQ9NT99 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRRC4BQ9NT99 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRRC4BQ9NT99 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRRC4BQ9NT99 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRRC4BQ9NT99 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
LRRC4BQ9NT99 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRRC4BQ9NT99 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRRC4BQ9NT99 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRRC4BQ9NT99 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRRC4BQ9NT99 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRRC4BQ9NT99 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRRC4BQ9NT99 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRRC4BQ9NT99 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRRC4BQ9NT99 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRRC4BQ9NT99 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRRC4BQ9NT99 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRRC4BQ9NT99 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
LRRC4BQ9NT99 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRRC4BQ9NT99 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRRC4BQ9NT99 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRRC4BQ9NT99 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRRC4BQ9NT99 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRRC4BQ9NT99 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRRC4BQ9NT99 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRRC4BQ9NT99 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRRC4BQ9NT99 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
LRRC4BQ9NT99 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRRC4BQ9NT99 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRRC4BQ9NT99 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRRC4BQ9NT99 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LRRC4BQ9NT99 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LRRC4BQ9NT99 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LRRC4BQ9NT99 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LRRC4BQ9NT99 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LRRC4BQ9NT99 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LRRC4BQ9NT99 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LRRC4BQ9NT99 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LRRC4BQ9NT99 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LRRC4BQ9NT99 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LRRC4BQ9NT99 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LRRC4BQ9NT99 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
LRRC4BQ9NT99 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LRRC4BQ9NT99 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LRRC4BQ9NT99 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LRRC4BQ9NT99 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LRRC4BQ9NT99 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms