Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZP0

PDGFD, Platelet-derived growth factor D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFDQ9GZP0 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDGFDQ9GZP0 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDGFDQ9GZP0 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDGFDQ9GZP0 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDGFDQ9GZP0 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDGFDQ9GZP0 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDGFDQ9GZP0 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDGFDQ9GZP0 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PDGFDQ9GZP0 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PDGFDQ9GZP0 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
PDGFDQ9GZP0 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PDGFDQ9GZP0 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDGFDQ9GZP0 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDGFDQ9GZP0 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDGFDQ9GZP0 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDGFDQ9GZP0 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDGFDQ9GZP0 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDGFDQ9GZP0 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDGFDQ9GZP0 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PDGFDQ9GZP0 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDGFDQ9GZP0 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDGFDQ9GZP0 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDGFDQ9GZP0 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDGFDQ9GZP0 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDGFDQ9GZP0 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDGFDQ9GZP0 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PDGFDQ9GZP0 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDGFDQ9GZP0 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDGFDQ9GZP0 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDGFDQ9GZP0 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDGFDQ9GZP0 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PDGFDQ9GZP0 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDGFDQ9GZP0 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDGFDQ9GZP0 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDGFDQ9GZP0 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDGFDQ9GZP0 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDGFDQ9GZP0 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDGFDQ9GZP0 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDGFDQ9GZP0 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDGFDQ9GZP0 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDGFDQ9GZP0 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDGFDQ9GZP0 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDGFDQ9GZP0 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDGFDQ9GZP0 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDGFDQ9GZP0 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDGFDQ9GZP0 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDGFDQ9GZP0 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PDGFDQ9GZP0 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDGFDQ9GZP0 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDGFDQ9GZP0 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDGFDQ9GZP0 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PDGFDQ9GZP0 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PDGFDQ9GZP0 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDGFDQ9GZP0 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDGFDQ9GZP0 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDGFDQ9GZP0 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDGFDQ9GZP0 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDGFDQ9GZP0 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDGFDQ9GZP0 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDGFDQ9GZP0 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDGFDQ9GZP0 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDGFDQ9GZP0 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDGFDQ9GZP0 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDGFDQ9GZP0 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDGFDQ9GZP0 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDGFDQ9GZP0 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDGFDQ9GZP0 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PDGFDQ9GZP0 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PDGFDQ9GZP0 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDGFDQ9GZP0 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDGFDQ9GZP0 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDGFDQ9GZP0 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDGFDQ9GZP0 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDGFDQ9GZP0 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDGFDQ9GZP0 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDGFDQ9GZP0 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDGFDQ9GZP0 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDGFDQ9GZP0 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDGFDQ9GZP0 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDGFDQ9GZP0 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDGFDQ9GZP0 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDGFDQ9GZP0 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDGFDQ9GZP0 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDGFDQ9GZP0 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDGFDQ9GZP0 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDGFDQ9GZP0 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDGFDQ9GZP0 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PDGFDQ9GZP0 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PDGFDQ9GZP0 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDGFDQ9GZP0 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDGFDQ9GZP0 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDGFDQ9GZP0 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDGFDQ9GZP0 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDGFDQ9GZP0 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PDGFDQ9GZP0 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PDGFDQ9GZP0 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDGFDQ9GZP0 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDGFDQ9GZP0 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDGFDQ9GZP0 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDGFDQ9GZP0 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms