Protein–RNA interactions for Protein: Q96ST3

SIN3A, Paired amphipathic helix protein Sin3a, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3AQ96ST3 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SIN3AQ96ST3 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SIN3AQ96ST3 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SIN3AQ96ST3 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SIN3AQ96ST3 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SIN3AQ96ST3 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SIN3AQ96ST3 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SIN3AQ96ST3 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SIN3AQ96ST3 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SIN3AQ96ST3 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SIN3AQ96ST3 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SIN3AQ96ST3 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
SIN3AQ96ST3 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SIN3AQ96ST3 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SIN3AQ96ST3 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SIN3AQ96ST3 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SIN3AQ96ST3 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SIN3AQ96ST3 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SIN3AQ96ST3 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SIN3AQ96ST3 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
SIN3AQ96ST3 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SIN3AQ96ST3 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SIN3AQ96ST3 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SIN3AQ96ST3 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SIN3AQ96ST3 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SIN3AQ96ST3 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SIN3AQ96ST3 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SIN3AQ96ST3 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SIN3AQ96ST3 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SIN3AQ96ST3 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SIN3AQ96ST3 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SIN3AQ96ST3 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SIN3AQ96ST3 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SIN3AQ96ST3 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
SIN3AQ96ST3 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SIN3AQ96ST3 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SIN3AQ96ST3 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SIN3AQ96ST3 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SIN3AQ96ST3 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SIN3AQ96ST3 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SIN3AQ96ST3 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SIN3AQ96ST3 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SIN3AQ96ST3 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SIN3AQ96ST3 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SIN3AQ96ST3 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SIN3AQ96ST3 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SIN3AQ96ST3 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SIN3AQ96ST3 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SIN3AQ96ST3 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SIN3AQ96ST3 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SIN3AQ96ST3 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
SIN3AQ96ST3 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
SIN3AQ96ST3 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SIN3AQ96ST3 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
SIN3AQ96ST3 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
SIN3AQ96ST3 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SIN3AQ96ST3 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SIN3AQ96ST3 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SIN3AQ96ST3 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
SIN3AQ96ST3 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SIN3AQ96ST3 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SIN3AQ96ST3 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SIN3AQ96ST3 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SIN3AQ96ST3 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SIN3AQ96ST3 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SIN3AQ96ST3 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SIN3AQ96ST3 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SIN3AQ96ST3 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SIN3AQ96ST3 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SIN3AQ96ST3 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SIN3AQ96ST3 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SIN3AQ96ST3 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SIN3AQ96ST3 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SIN3AQ96ST3 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SIN3AQ96ST3 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SIN3AQ96ST3 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SIN3AQ96ST3 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SIN3AQ96ST3 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
SIN3AQ96ST3 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SIN3AQ96ST3 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SIN3AQ96ST3 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SIN3AQ96ST3 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SIN3AQ96ST3 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SIN3AQ96ST3 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SIN3AQ96ST3 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SIN3AQ96ST3 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SIN3AQ96ST3 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SIN3AQ96ST3 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SIN3AQ96ST3 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SIN3AQ96ST3 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SIN3AQ96ST3 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SIN3AQ96ST3 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SIN3AQ96ST3 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SIN3AQ96ST3 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SIN3AQ96ST3 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SIN3AQ96ST3 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SIN3AQ96ST3 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SIN3AQ96ST3 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SIN3AQ96ST3 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SIN3AQ96ST3 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms