Protein–RNA interactions for Protein: Q96K76

USP47, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 47, humanhuman

Predictions only

Length 1,375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP47Q96K76 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
USP47Q96K76 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
USP47Q96K76 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
USP47Q96K76 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
USP47Q96K76 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
USP47Q96K76 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
USP47Q96K76 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
USP47Q96K76 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
USP47Q96K76 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
USP47Q96K76 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
USP47Q96K76 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
USP47Q96K76 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
USP47Q96K76 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
USP47Q96K76 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
USP47Q96K76 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
USP47Q96K76 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
USP47Q96K76 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
USP47Q96K76 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
USP47Q96K76 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
USP47Q96K76 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
USP47Q96K76 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
USP47Q96K76 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
USP47Q96K76 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
USP47Q96K76 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
USP47Q96K76 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
USP47Q96K76 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
USP47Q96K76 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
USP47Q96K76 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
USP47Q96K76 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
USP47Q96K76 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
USP47Q96K76 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
USP47Q96K76 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
USP47Q96K76 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
USP47Q96K76 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
USP47Q96K76 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
USP47Q96K76 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
USP47Q96K76 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
USP47Q96K76 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
USP47Q96K76 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
USP47Q96K76 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
USP47Q96K76 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
USP47Q96K76 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
USP47Q96K76 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
USP47Q96K76 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
USP47Q96K76 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
USP47Q96K76 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
USP47Q96K76 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
USP47Q96K76 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
USP47Q96K76 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
USP47Q96K76 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
USP47Q96K76 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
USP47Q96K76 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
USP47Q96K76 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
USP47Q96K76 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
USP47Q96K76 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
USP47Q96K76 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
USP47Q96K76 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
USP47Q96K76 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
USP47Q96K76 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
USP47Q96K76 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
USP47Q96K76 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
USP47Q96K76 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
USP47Q96K76 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP47Q96K76 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP47Q96K76 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP47Q96K76 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP47Q96K76 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP47Q96K76 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP47Q96K76 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP47Q96K76 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP47Q96K76 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP47Q96K76 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP47Q96K76 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP47Q96K76 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP47Q96K76 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP47Q96K76 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP47Q96K76 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP47Q96K76 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP47Q96K76 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
USP47Q96K76 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP47Q96K76 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP47Q96K76 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP47Q96K76 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
USP47Q96K76 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
USP47Q96K76 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
USP47Q96K76 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
USP47Q96K76 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
USP47Q96K76 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
USP47Q96K76 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
USP47Q96K76 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
USP47Q96K76 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
USP47Q96K76 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
USP47Q96K76 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
USP47Q96K76 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
USP47Q96K76 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
USP47Q96K76 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
USP47Q96K76 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
USP47Q96K76 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
USP47Q96K76 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
USP47Q96K76 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms