Protein–RNA interactions for Protein: Q96DT6

ATG4C, Cysteine protease ATG4C, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4CQ96DT6 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATG4CQ96DT6 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATG4CQ96DT6 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATG4CQ96DT6 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATG4CQ96DT6 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATG4CQ96DT6 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATG4CQ96DT6 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATG4CQ96DT6 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATG4CQ96DT6 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATG4CQ96DT6 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATG4CQ96DT6 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATG4CQ96DT6 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATG4CQ96DT6 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATG4CQ96DT6 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATG4CQ96DT6 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATG4CQ96DT6 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATG4CQ96DT6 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATG4CQ96DT6 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATG4CQ96DT6 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATG4CQ96DT6 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATG4CQ96DT6 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATG4CQ96DT6 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATG4CQ96DT6 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATG4CQ96DT6 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATG4CQ96DT6 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATG4CQ96DT6 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATG4CQ96DT6 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATG4CQ96DT6 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
ATG4CQ96DT6 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATG4CQ96DT6 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATG4CQ96DT6 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATG4CQ96DT6 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATG4CQ96DT6 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATG4CQ96DT6 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATG4CQ96DT6 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATG4CQ96DT6 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATG4CQ96DT6 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATG4CQ96DT6 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATG4CQ96DT6 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATG4CQ96DT6 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATG4CQ96DT6 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATG4CQ96DT6 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATG4CQ96DT6 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
ATG4CQ96DT6 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
ATG4CQ96DT6 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATG4CQ96DT6 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATG4CQ96DT6 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATG4CQ96DT6 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATG4CQ96DT6 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATG4CQ96DT6 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATG4CQ96DT6 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATG4CQ96DT6 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATG4CQ96DT6 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATG4CQ96DT6 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATG4CQ96DT6 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATG4CQ96DT6 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATG4CQ96DT6 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATG4CQ96DT6 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
ATG4CQ96DT6 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATG4CQ96DT6 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATG4CQ96DT6 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATG4CQ96DT6 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATG4CQ96DT6 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATG4CQ96DT6 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATG4CQ96DT6 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATG4CQ96DT6 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATG4CQ96DT6 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATG4CQ96DT6 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATG4CQ96DT6 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
ATG4CQ96DT6 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
ATG4CQ96DT6 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
ATG4CQ96DT6 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATG4CQ96DT6 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATG4CQ96DT6 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATG4CQ96DT6 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATG4CQ96DT6 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATG4CQ96DT6 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATG4CQ96DT6 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATG4CQ96DT6 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATG4CQ96DT6 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATG4CQ96DT6 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATG4CQ96DT6 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATG4CQ96DT6 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATG4CQ96DT6 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATG4CQ96DT6 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATG4CQ96DT6 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATG4CQ96DT6 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATG4CQ96DT6 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATG4CQ96DT6 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATG4CQ96DT6 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATG4CQ96DT6 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATG4CQ96DT6 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATG4CQ96DT6 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATG4CQ96DT6 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATG4CQ96DT6 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATG4CQ96DT6 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATG4CQ96DT6 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATG4CQ96DT6 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
ATG4CQ96DT6 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATG4CQ96DT6 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms