Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEQ0

SNX29, Sorting nexin-29, humanhuman

Predictions only

Length 813 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX29Q8TEQ0 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SNX29Q8TEQ0 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNX29Q8TEQ0 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNX29Q8TEQ0 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SNX29Q8TEQ0 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SNX29Q8TEQ0 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNX29Q8TEQ0 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNX29Q8TEQ0 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNX29Q8TEQ0 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNX29Q8TEQ0 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SNX29Q8TEQ0 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNX29Q8TEQ0 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNX29Q8TEQ0 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SNX29Q8TEQ0 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNX29Q8TEQ0 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNX29Q8TEQ0 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNX29Q8TEQ0 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNX29Q8TEQ0 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNX29Q8TEQ0 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNX29Q8TEQ0 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNX29Q8TEQ0 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNX29Q8TEQ0 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNX29Q8TEQ0 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNX29Q8TEQ0 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNX29Q8TEQ0 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
SNX29Q8TEQ0 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNX29Q8TEQ0 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNX29Q8TEQ0 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNX29Q8TEQ0 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNX29Q8TEQ0 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNX29Q8TEQ0 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNX29Q8TEQ0 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNX29Q8TEQ0 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNX29Q8TEQ0 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNX29Q8TEQ0 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNX29Q8TEQ0 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNX29Q8TEQ0 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNX29Q8TEQ0 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNX29Q8TEQ0 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNX29Q8TEQ0 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNX29Q8TEQ0 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNX29Q8TEQ0 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNX29Q8TEQ0 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNX29Q8TEQ0 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SNX29Q8TEQ0 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNX29Q8TEQ0 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SNX29Q8TEQ0 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNX29Q8TEQ0 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNX29Q8TEQ0 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNX29Q8TEQ0 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNX29Q8TEQ0 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNX29Q8TEQ0 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNX29Q8TEQ0 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNX29Q8TEQ0 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNX29Q8TEQ0 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNX29Q8TEQ0 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNX29Q8TEQ0 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNX29Q8TEQ0 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNX29Q8TEQ0 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNX29Q8TEQ0 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNX29Q8TEQ0 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNX29Q8TEQ0 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNX29Q8TEQ0 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNX29Q8TEQ0 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNX29Q8TEQ0 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNX29Q8TEQ0 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNX29Q8TEQ0 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNX29Q8TEQ0 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNX29Q8TEQ0 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNX29Q8TEQ0 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNX29Q8TEQ0 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNX29Q8TEQ0 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNX29Q8TEQ0 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SNX29Q8TEQ0 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNX29Q8TEQ0 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNX29Q8TEQ0 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNX29Q8TEQ0 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNX29Q8TEQ0 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SNX29Q8TEQ0 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNX29Q8TEQ0 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNX29Q8TEQ0 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SNX29Q8TEQ0 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SNX29Q8TEQ0 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNX29Q8TEQ0 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNX29Q8TEQ0 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNX29Q8TEQ0 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNX29Q8TEQ0 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNX29Q8TEQ0 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNX29Q8TEQ0 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNX29Q8TEQ0 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SNX29Q8TEQ0 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNX29Q8TEQ0 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNX29Q8TEQ0 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNX29Q8TEQ0 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNX29Q8TEQ0 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNX29Q8TEQ0 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNX29Q8TEQ0 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNX29Q8TEQ0 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNX29Q8TEQ0 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNX29Q8TEQ0 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.5 ms