Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9W5

DNAAF3, Dynein assembly factor 3, axonemal, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAAF3Q8N9W5 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DNAAF3Q8N9W5 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DNAAF3Q8N9W5 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
DNAAF3Q8N9W5 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DNAAF3Q8N9W5 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DNAAF3Q8N9W5 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DNAAF3Q8N9W5 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DNAAF3Q8N9W5 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DNAAF3Q8N9W5 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DNAAF3Q8N9W5 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DNAAF3Q8N9W5 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DNAAF3Q8N9W5 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DNAAF3Q8N9W5 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DNAAF3Q8N9W5 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DNAAF3Q8N9W5 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DNAAF3Q8N9W5 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DNAAF3Q8N9W5 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DNAAF3Q8N9W5 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DNAAF3Q8N9W5 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DNAAF3Q8N9W5 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DNAAF3Q8N9W5 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DNAAF3Q8N9W5 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DNAAF3Q8N9W5 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DNAAF3Q8N9W5 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DNAAF3Q8N9W5 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DNAAF3Q8N9W5 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DNAAF3Q8N9W5 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DNAAF3Q8N9W5 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DNAAF3Q8N9W5 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DNAAF3Q8N9W5 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DNAAF3Q8N9W5 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
DNAAF3Q8N9W5 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DNAAF3Q8N9W5 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DNAAF3Q8N9W5 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
DNAAF3Q8N9W5 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
DNAAF3Q8N9W5 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DNAAF3Q8N9W5 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DNAAF3Q8N9W5 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DNAAF3Q8N9W5 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DNAAF3Q8N9W5 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DNAAF3Q8N9W5 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DNAAF3Q8N9W5 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
DNAAF3Q8N9W5 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DNAAF3Q8N9W5 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DNAAF3Q8N9W5 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DNAAF3Q8N9W5 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DNAAF3Q8N9W5 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DNAAF3Q8N9W5 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DNAAF3Q8N9W5 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DNAAF3Q8N9W5 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DNAAF3Q8N9W5 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DNAAF3Q8N9W5 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DNAAF3Q8N9W5 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DNAAF3Q8N9W5 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DNAAF3Q8N9W5 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DNAAF3Q8N9W5 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
DNAAF3Q8N9W5 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DNAAF3Q8N9W5 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DNAAF3Q8N9W5 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DNAAF3Q8N9W5 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DNAAF3Q8N9W5 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DNAAF3Q8N9W5 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DNAAF3Q8N9W5 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DNAAF3Q8N9W5 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DNAAF3Q8N9W5 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DNAAF3Q8N9W5 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DNAAF3Q8N9W5 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DNAAF3Q8N9W5 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
DNAAF3Q8N9W5 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DNAAF3Q8N9W5 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DNAAF3Q8N9W5 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DNAAF3Q8N9W5 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DNAAF3Q8N9W5 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DNAAF3Q8N9W5 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DNAAF3Q8N9W5 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DNAAF3Q8N9W5 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DNAAF3Q8N9W5 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DNAAF3Q8N9W5 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DNAAF3Q8N9W5 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DNAAF3Q8N9W5 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DNAAF3Q8N9W5 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DNAAF3Q8N9W5 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DNAAF3Q8N9W5 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DNAAF3Q8N9W5 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DNAAF3Q8N9W5 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DNAAF3Q8N9W5 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DNAAF3Q8N9W5 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
DNAAF3Q8N9W5 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DNAAF3Q8N9W5 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
DNAAF3Q8N9W5 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
DNAAF3Q8N9W5 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DNAAF3Q8N9W5 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
DNAAF3Q8N9W5 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DNAAF3Q8N9W5 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
DNAAF3Q8N9W5 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DNAAF3Q8N9W5 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
DNAAF3Q8N9W5 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DNAAF3Q8N9W5 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DNAAF3Q8N9W5 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
DNAAF3Q8N9W5 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms