Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9I9

DTX3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase DTX3, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX3Q8N9I9 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DTX3Q8N9I9 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DTX3Q8N9I9 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DTX3Q8N9I9 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DTX3Q8N9I9 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DTX3Q8N9I9 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DTX3Q8N9I9 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DTX3Q8N9I9 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
DTX3Q8N9I9 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DTX3Q8N9I9 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DTX3Q8N9I9 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DTX3Q8N9I9 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
DTX3Q8N9I9 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DTX3Q8N9I9 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DTX3Q8N9I9 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DTX3Q8N9I9 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DTX3Q8N9I9 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DTX3Q8N9I9 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DTX3Q8N9I9 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DTX3Q8N9I9 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DTX3Q8N9I9 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DTX3Q8N9I9 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DTX3Q8N9I9 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DTX3Q8N9I9 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DTX3Q8N9I9 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DTX3Q8N9I9 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DTX3Q8N9I9 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DTX3Q8N9I9 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DTX3Q8N9I9 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DTX3Q8N9I9 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DTX3Q8N9I9 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DTX3Q8N9I9 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DTX3Q8N9I9 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
DTX3Q8N9I9 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DTX3Q8N9I9 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DTX3Q8N9I9 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DTX3Q8N9I9 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DTX3Q8N9I9 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DTX3Q8N9I9 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DTX3Q8N9I9 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DTX3Q8N9I9 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DTX3Q8N9I9 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DTX3Q8N9I9 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DTX3Q8N9I9 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DTX3Q8N9I9 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DTX3Q8N9I9 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DTX3Q8N9I9 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DTX3Q8N9I9 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
DTX3Q8N9I9 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DTX3Q8N9I9 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DTX3Q8N9I9 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DTX3Q8N9I9 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DTX3Q8N9I9 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DTX3Q8N9I9 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DTX3Q8N9I9 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DTX3Q8N9I9 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DTX3Q8N9I9 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DTX3Q8N9I9 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DTX3Q8N9I9 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DTX3Q8N9I9 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DTX3Q8N9I9 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DTX3Q8N9I9 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DTX3Q8N9I9 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DTX3Q8N9I9 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DTX3Q8N9I9 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DTX3Q8N9I9 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DTX3Q8N9I9 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DTX3Q8N9I9 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DTX3Q8N9I9 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DTX3Q8N9I9 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DTX3Q8N9I9 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DTX3Q8N9I9 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DTX3Q8N9I9 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DTX3Q8N9I9 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DTX3Q8N9I9 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DTX3Q8N9I9 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DTX3Q8N9I9 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DTX3Q8N9I9 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DTX3Q8N9I9 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DTX3Q8N9I9 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DTX3Q8N9I9 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DTX3Q8N9I9 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DTX3Q8N9I9 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DTX3Q8N9I9 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DTX3Q8N9I9 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DTX3Q8N9I9 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DTX3Q8N9I9 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DTX3Q8N9I9 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
DTX3Q8N9I9 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DTX3Q8N9I9 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
DTX3Q8N9I9 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DTX3Q8N9I9 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DTX3Q8N9I9 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DTX3Q8N9I9 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DTX3Q8N9I9 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DTX3Q8N9I9 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DTX3Q8N9I9 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DTX3Q8N9I9 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DTX3Q8N9I9 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
DTX3Q8N9I9 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.1 ms