Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6U2

LINC00612, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00612, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00612Q8N6U2 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
LINC00612Q8N6U2 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
LINC00612Q8N6U2 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
LINC00612Q8N6U2 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
LINC00612Q8N6U2 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
LINC00612Q8N6U2 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
LINC00612Q8N6U2 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
LINC00612Q8N6U2 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
LINC00612Q8N6U2 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
LINC00612Q8N6U2 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
LINC00612Q8N6U2 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
LINC00612Q8N6U2 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
LINC00612Q8N6U2 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
LINC00612Q8N6U2 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
LINC00612Q8N6U2 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
LINC00612Q8N6U2 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
LINC00612Q8N6U2 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
LINC00612Q8N6U2 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
LINC00612Q8N6U2 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
LINC00612Q8N6U2 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
LINC00612Q8N6U2 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
LINC00612Q8N6U2 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
LINC00612Q8N6U2 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
LINC00612Q8N6U2 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
LINC00612Q8N6U2 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
LINC00612Q8N6U2 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
LINC00612Q8N6U2 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
LINC00612Q8N6U2 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
LINC00612Q8N6U2 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
LINC00612Q8N6U2 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
LINC00612Q8N6U2 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
LINC00612Q8N6U2 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
LINC00612Q8N6U2 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
LINC00612Q8N6U2 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
LINC00612Q8N6U2 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
LINC00612Q8N6U2 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
LINC00612Q8N6U2 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
LINC00612Q8N6U2 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
LINC00612Q8N6U2 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
LINC00612Q8N6U2 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
LINC00612Q8N6U2 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
LINC00612Q8N6U2 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
LINC00612Q8N6U2 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
LINC00612Q8N6U2 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC12.62□□□□□ -0.39
LINC00612Q8N6U2 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
LINC00612Q8N6U2 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
LINC00612Q8N6U2 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
LINC00612Q8N6U2 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
LINC00612Q8N6U2 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
LINC00612Q8N6U2 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
LINC00612Q8N6U2 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
LINC00612Q8N6U2 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
LINC00612Q8N6U2 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
LINC00612Q8N6U2 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
LINC00612Q8N6U2 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
LINC00612Q8N6U2 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
LINC00612Q8N6U2 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
LINC00612Q8N6U2 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
LINC00612Q8N6U2 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
LINC00612Q8N6U2 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
LINC00612Q8N6U2 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
LINC00612Q8N6U2 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
LINC00612Q8N6U2 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
LINC00612Q8N6U2 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC12.62□□□□□ -0.39
LINC00612Q8N6U2 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
LINC00612Q8N6U2 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
LINC00612Q8N6U2 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
LINC00612Q8N6U2 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
LINC00612Q8N6U2 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
LINC00612Q8N6U2 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
LINC00612Q8N6U2 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
LINC00612Q8N6U2 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
LINC00612Q8N6U2 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
LINC00612Q8N6U2 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC12.61□□□□□ -0.39
LINC00612Q8N6U2 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
LINC00612Q8N6U2 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
LINC00612Q8N6U2 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
LINC00612Q8N6U2 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
LINC00612Q8N6U2 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
LINC00612Q8N6U2 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
LINC00612Q8N6U2 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
LINC00612Q8N6U2 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
LINC00612Q8N6U2 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
LINC00612Q8N6U2 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC12.61□□□□□ -0.39
LINC00612Q8N6U2 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
LINC00612Q8N6U2 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
LINC00612Q8N6U2 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
LINC00612Q8N6U2 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
LINC00612Q8N6U2 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
LINC00612Q8N6U2 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
LINC00612Q8N6U2 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
LINC00612Q8N6U2 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
LINC00612Q8N6U2 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
LINC00612Q8N6U2 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
LINC00612Q8N6U2 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC12.61□□□□□ -0.39
LINC00612Q8N6U2 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
LINC00612Q8N6U2 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
LINC00612Q8N6U2 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
LINC00612Q8N6U2 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
LINC00612Q8N6U2 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms