Protein–RNA interactions for Protein: Q86VB7

CD163, Scavenger receptor cysteine-rich type 1 protein M130, humanhuman

Predictions only

Length 1,156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD163Q86VB7 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD163Q86VB7 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD163Q86VB7 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD163Q86VB7 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD163Q86VB7 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD163Q86VB7 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD163Q86VB7 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD163Q86VB7 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD163Q86VB7 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD163Q86VB7 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD163Q86VB7 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD163Q86VB7 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD163Q86VB7 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD163Q86VB7 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD163Q86VB7 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD163Q86VB7 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD163Q86VB7 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD163Q86VB7 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD163Q86VB7 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD163Q86VB7 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD163Q86VB7 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD163Q86VB7 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD163Q86VB7 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD163Q86VB7 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD163Q86VB7 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD163Q86VB7 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD163Q86VB7 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD163Q86VB7 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CD163Q86VB7 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CD163Q86VB7 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD163Q86VB7 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD163Q86VB7 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CD163Q86VB7 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD163Q86VB7 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD163Q86VB7 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD163Q86VB7 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD163Q86VB7 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD163Q86VB7 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD163Q86VB7 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD163Q86VB7 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD163Q86VB7 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD163Q86VB7 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD163Q86VB7 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD163Q86VB7 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD163Q86VB7 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD163Q86VB7 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD163Q86VB7 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD163Q86VB7 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD163Q86VB7 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD163Q86VB7 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD163Q86VB7 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD163Q86VB7 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD163Q86VB7 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD163Q86VB7 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD163Q86VB7 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD163Q86VB7 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CD163Q86VB7 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD163Q86VB7 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD163Q86VB7 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD163Q86VB7 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD163Q86VB7 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD163Q86VB7 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD163Q86VB7 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CD163Q86VB7 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD163Q86VB7 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CD163Q86VB7 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD163Q86VB7 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD163Q86VB7 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD163Q86VB7 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD163Q86VB7 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD163Q86VB7 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CD163Q86VB7 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CD163Q86VB7 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD163Q86VB7 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD163Q86VB7 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD163Q86VB7 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD163Q86VB7 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD163Q86VB7 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD163Q86VB7 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD163Q86VB7 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CD163Q86VB7 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD163Q86VB7 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD163Q86VB7 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD163Q86VB7 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CD163Q86VB7 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CD163Q86VB7 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CD163Q86VB7 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CD163Q86VB7 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CD163Q86VB7 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CD163Q86VB7 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CD163Q86VB7 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CD163Q86VB7 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CD163Q86VB7 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CD163Q86VB7 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CD163Q86VB7 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CD163Q86VB7 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CD163Q86VB7 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CD163Q86VB7 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CD163Q86VB7 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CD163Q86VB7 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms