Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZU67

BEND4, BEN domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEND4Q6ZU67 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
BEND4Q6ZU67 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BEND4Q6ZU67 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
BEND4Q6ZU67 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BEND4Q6ZU67 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
BEND4Q6ZU67 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BEND4Q6ZU67 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BEND4Q6ZU67 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BEND4Q6ZU67 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BEND4Q6ZU67 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BEND4Q6ZU67 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BEND4Q6ZU67 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BEND4Q6ZU67 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BEND4Q6ZU67 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BEND4Q6ZU67 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BEND4Q6ZU67 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BEND4Q6ZU67 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BEND4Q6ZU67 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BEND4Q6ZU67 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BEND4Q6ZU67 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BEND4Q6ZU67 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BEND4Q6ZU67 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BEND4Q6ZU67 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BEND4Q6ZU67 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BEND4Q6ZU67 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BEND4Q6ZU67 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BEND4Q6ZU67 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BEND4Q6ZU67 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
BEND4Q6ZU67 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BEND4Q6ZU67 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BEND4Q6ZU67 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BEND4Q6ZU67 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
BEND4Q6ZU67 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BEND4Q6ZU67 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BEND4Q6ZU67 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BEND4Q6ZU67 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BEND4Q6ZU67 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BEND4Q6ZU67 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BEND4Q6ZU67 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BEND4Q6ZU67 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BEND4Q6ZU67 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
BEND4Q6ZU67 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BEND4Q6ZU67 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BEND4Q6ZU67 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BEND4Q6ZU67 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BEND4Q6ZU67 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BEND4Q6ZU67 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BEND4Q6ZU67 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BEND4Q6ZU67 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BEND4Q6ZU67 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BEND4Q6ZU67 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BEND4Q6ZU67 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BEND4Q6ZU67 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BEND4Q6ZU67 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BEND4Q6ZU67 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BEND4Q6ZU67 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BEND4Q6ZU67 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BEND4Q6ZU67 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BEND4Q6ZU67 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BEND4Q6ZU67 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BEND4Q6ZU67 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BEND4Q6ZU67 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
BEND4Q6ZU67 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BEND4Q6ZU67 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BEND4Q6ZU67 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BEND4Q6ZU67 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
BEND4Q6ZU67 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BEND4Q6ZU67 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BEND4Q6ZU67 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
BEND4Q6ZU67 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BEND4Q6ZU67 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
BEND4Q6ZU67 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
BEND4Q6ZU67 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BEND4Q6ZU67 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BEND4Q6ZU67 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BEND4Q6ZU67 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BEND4Q6ZU67 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BEND4Q6ZU67 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BEND4Q6ZU67 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BEND4Q6ZU67 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BEND4Q6ZU67 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BEND4Q6ZU67 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BEND4Q6ZU67 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BEND4Q6ZU67 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BEND4Q6ZU67 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BEND4Q6ZU67 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BEND4Q6ZU67 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BEND4Q6ZU67 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
BEND4Q6ZU67 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BEND4Q6ZU67 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BEND4Q6ZU67 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BEND4Q6ZU67 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
BEND4Q6ZU67 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
BEND4Q6ZU67 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BEND4Q6ZU67 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BEND4Q6ZU67 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BEND4Q6ZU67 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BEND4Q6ZU67 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BEND4Q6ZU67 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BEND4Q6ZU67 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms