Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXF1

TMEM108, Transmembrane protein 108, humanhuman

Predictions only

Length 575 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM108Q6UXF1 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM108Q6UXF1 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM108Q6UXF1 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM108Q6UXF1 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM108Q6UXF1 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM108Q6UXF1 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM108Q6UXF1 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM108Q6UXF1 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM108Q6UXF1 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM108Q6UXF1 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM108Q6UXF1 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM108Q6UXF1 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM108Q6UXF1 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM108Q6UXF1 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM108Q6UXF1 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM108Q6UXF1 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM108Q6UXF1 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM108Q6UXF1 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM108Q6UXF1 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM108Q6UXF1 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM108Q6UXF1 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM108Q6UXF1 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM108Q6UXF1 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM108Q6UXF1 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM108Q6UXF1 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM108Q6UXF1 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM108Q6UXF1 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM108Q6UXF1 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM108Q6UXF1 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM108Q6UXF1 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM108Q6UXF1 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM108Q6UXF1 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM108Q6UXF1 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM108Q6UXF1 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM108Q6UXF1 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM108Q6UXF1 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM108Q6UXF1 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM108Q6UXF1 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM108Q6UXF1 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM108Q6UXF1 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM108Q6UXF1 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM108Q6UXF1 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM108Q6UXF1 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM108Q6UXF1 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM108Q6UXF1 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM108Q6UXF1 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM108Q6UXF1 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM108Q6UXF1 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM108Q6UXF1 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM108Q6UXF1 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM108Q6UXF1 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM108Q6UXF1 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM108Q6UXF1 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM108Q6UXF1 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM108Q6UXF1 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM108Q6UXF1 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM108Q6UXF1 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM108Q6UXF1 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM108Q6UXF1 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM108Q6UXF1 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM108Q6UXF1 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM108Q6UXF1 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM108Q6UXF1 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM108Q6UXF1 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM108Q6UXF1 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM108Q6UXF1 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM108Q6UXF1 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM108Q6UXF1 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM108Q6UXF1 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM108Q6UXF1 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM108Q6UXF1 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM108Q6UXF1 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM108Q6UXF1 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM108Q6UXF1 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM108Q6UXF1 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM108Q6UXF1 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM108Q6UXF1 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM108Q6UXF1 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM108Q6UXF1 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM108Q6UXF1 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM108Q6UXF1 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM108Q6UXF1 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM108Q6UXF1 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM108Q6UXF1 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM108Q6UXF1 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM108Q6UXF1 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM108Q6UXF1 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM108Q6UXF1 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM108Q6UXF1 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM108Q6UXF1 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM108Q6UXF1 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM108Q6UXF1 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM108Q6UXF1 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM108Q6UXF1 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM108Q6UXF1 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM108Q6UXF1 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM108Q6UXF1 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM108Q6UXF1 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM108Q6UXF1 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM108Q6UXF1 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.1 ms