Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1Q0

LETMD1, LETM1 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETMD1Q6P1Q0 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
LETMD1Q6P1Q0 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LETMD1Q6P1Q0 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LETMD1Q6P1Q0 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LETMD1Q6P1Q0 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
LETMD1Q6P1Q0 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LETMD1Q6P1Q0 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LETMD1Q6P1Q0 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
LETMD1Q6P1Q0 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LETMD1Q6P1Q0 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LETMD1Q6P1Q0 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LETMD1Q6P1Q0 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LETMD1Q6P1Q0 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
LETMD1Q6P1Q0 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
LETMD1Q6P1Q0 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LETMD1Q6P1Q0 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LETMD1Q6P1Q0 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LETMD1Q6P1Q0 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
LETMD1Q6P1Q0 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
LETMD1Q6P1Q0 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LETMD1Q6P1Q0 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LETMD1Q6P1Q0 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LETMD1Q6P1Q0 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LETMD1Q6P1Q0 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LETMD1Q6P1Q0 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LETMD1Q6P1Q0 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LETMD1Q6P1Q0 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
LETMD1Q6P1Q0 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LETMD1Q6P1Q0 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LETMD1Q6P1Q0 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LETMD1Q6P1Q0 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
LETMD1Q6P1Q0 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LETMD1Q6P1Q0 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LETMD1Q6P1Q0 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LETMD1Q6P1Q0 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LETMD1Q6P1Q0 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LETMD1Q6P1Q0 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LETMD1Q6P1Q0 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LETMD1Q6P1Q0 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LETMD1Q6P1Q0 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LETMD1Q6P1Q0 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LETMD1Q6P1Q0 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LETMD1Q6P1Q0 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LETMD1Q6P1Q0 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
LETMD1Q6P1Q0 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
LETMD1Q6P1Q0 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LETMD1Q6P1Q0 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LETMD1Q6P1Q0 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LETMD1Q6P1Q0 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LETMD1Q6P1Q0 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LETMD1Q6P1Q0 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LETMD1Q6P1Q0 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LETMD1Q6P1Q0 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LETMD1Q6P1Q0 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LETMD1Q6P1Q0 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
LETMD1Q6P1Q0 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LETMD1Q6P1Q0 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LETMD1Q6P1Q0 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LETMD1Q6P1Q0 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LETMD1Q6P1Q0 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LETMD1Q6P1Q0 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LETMD1Q6P1Q0 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LETMD1Q6P1Q0 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
LETMD1Q6P1Q0 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
LETMD1Q6P1Q0 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
LETMD1Q6P1Q0 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
LETMD1Q6P1Q0 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
LETMD1Q6P1Q0 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
LETMD1Q6P1Q0 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
LETMD1Q6P1Q0 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LETMD1Q6P1Q0 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LETMD1Q6P1Q0 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
LETMD1Q6P1Q0 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LETMD1Q6P1Q0 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LETMD1Q6P1Q0 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LETMD1Q6P1Q0 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LETMD1Q6P1Q0 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LETMD1Q6P1Q0 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LETMD1Q6P1Q0 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
LETMD1Q6P1Q0 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LETMD1Q6P1Q0 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LETMD1Q6P1Q0 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LETMD1Q6P1Q0 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LETMD1Q6P1Q0 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LETMD1Q6P1Q0 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LETMD1Q6P1Q0 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
LETMD1Q6P1Q0 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LETMD1Q6P1Q0 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LETMD1Q6P1Q0 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LETMD1Q6P1Q0 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
LETMD1Q6P1Q0 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LETMD1Q6P1Q0 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LETMD1Q6P1Q0 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LETMD1Q6P1Q0 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LETMD1Q6P1Q0 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LETMD1Q6P1Q0 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LETMD1Q6P1Q0 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LETMD1Q6P1Q0 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LETMD1Q6P1Q0 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LETMD1Q6P1Q0 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms