Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVU6

UFSP1, Inactive Ufm1-specific protease 1, humanhuman

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFSP1Q6NVU6 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
UFSP1Q6NVU6 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
UFSP1Q6NVU6 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
UFSP1Q6NVU6 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
UFSP1Q6NVU6 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
UFSP1Q6NVU6 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
UFSP1Q6NVU6 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
UFSP1Q6NVU6 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
UFSP1Q6NVU6 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
UFSP1Q6NVU6 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
UFSP1Q6NVU6 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
UFSP1Q6NVU6 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
UFSP1Q6NVU6 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
UFSP1Q6NVU6 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
UFSP1Q6NVU6 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
UFSP1Q6NVU6 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
UFSP1Q6NVU6 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
UFSP1Q6NVU6 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
UFSP1Q6NVU6 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
UFSP1Q6NVU6 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
UFSP1Q6NVU6 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
UFSP1Q6NVU6 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
UFSP1Q6NVU6 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
UFSP1Q6NVU6 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
UFSP1Q6NVU6 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
UFSP1Q6NVU6 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
UFSP1Q6NVU6 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
UFSP1Q6NVU6 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
UFSP1Q6NVU6 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
UFSP1Q6NVU6 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
UFSP1Q6NVU6 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
UFSP1Q6NVU6 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
UFSP1Q6NVU6 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
UFSP1Q6NVU6 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
UFSP1Q6NVU6 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
UFSP1Q6NVU6 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
UFSP1Q6NVU6 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
UFSP1Q6NVU6 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
UFSP1Q6NVU6 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
UFSP1Q6NVU6 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
UFSP1Q6NVU6 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
UFSP1Q6NVU6 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
UFSP1Q6NVU6 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
UFSP1Q6NVU6 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
UFSP1Q6NVU6 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
UFSP1Q6NVU6 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
UFSP1Q6NVU6 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
UFSP1Q6NVU6 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
UFSP1Q6NVU6 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
UFSP1Q6NVU6 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
UFSP1Q6NVU6 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
UFSP1Q6NVU6 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
UFSP1Q6NVU6 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
UFSP1Q6NVU6 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
UFSP1Q6NVU6 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
UFSP1Q6NVU6 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
UFSP1Q6NVU6 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
UFSP1Q6NVU6 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
UFSP1Q6NVU6 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
UFSP1Q6NVU6 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
UFSP1Q6NVU6 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
UFSP1Q6NVU6 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
UFSP1Q6NVU6 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
UFSP1Q6NVU6 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
UFSP1Q6NVU6 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
UFSP1Q6NVU6 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
UFSP1Q6NVU6 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
UFSP1Q6NVU6 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
UFSP1Q6NVU6 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
UFSP1Q6NVU6 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
UFSP1Q6NVU6 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
UFSP1Q6NVU6 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
UFSP1Q6NVU6 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
UFSP1Q6NVU6 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
UFSP1Q6NVU6 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
UFSP1Q6NVU6 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
UFSP1Q6NVU6 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
UFSP1Q6NVU6 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
UFSP1Q6NVU6 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
UFSP1Q6NVU6 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
UFSP1Q6NVU6 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
UFSP1Q6NVU6 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
UFSP1Q6NVU6 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
UFSP1Q6NVU6 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
UFSP1Q6NVU6 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
UFSP1Q6NVU6 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
UFSP1Q6NVU6 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
UFSP1Q6NVU6 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
UFSP1Q6NVU6 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
UFSP1Q6NVU6 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
UFSP1Q6NVU6 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
UFSP1Q6NVU6 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
UFSP1Q6NVU6 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
UFSP1Q6NVU6 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
UFSP1Q6NVU6 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
UFSP1Q6NVU6 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
UFSP1Q6NVU6 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
UFSP1Q6NVU6 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
UFSP1Q6NVU6 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
UFSP1Q6NVU6 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms