Protein–RNA interactions for Protein: Q6JVE6

LCN10, Epididymal-specific lipocalin-10, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCN10Q6JVE6 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LCN10Q6JVE6 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LCN10Q6JVE6 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LCN10Q6JVE6 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LCN10Q6JVE6 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LCN10Q6JVE6 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LCN10Q6JVE6 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LCN10Q6JVE6 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LCN10Q6JVE6 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
LCN10Q6JVE6 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LCN10Q6JVE6 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LCN10Q6JVE6 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LCN10Q6JVE6 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LCN10Q6JVE6 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LCN10Q6JVE6 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LCN10Q6JVE6 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
LCN10Q6JVE6 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LCN10Q6JVE6 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
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LCN10Q6JVE6 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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LCN10Q6JVE6 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LCN10Q6JVE6 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LCN10Q6JVE6 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LCN10Q6JVE6 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LCN10Q6JVE6 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LCN10Q6JVE6 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LCN10Q6JVE6 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LCN10Q6JVE6 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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LCN10Q6JVE6 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
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LCN10Q6JVE6 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LCN10Q6JVE6 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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LCN10Q6JVE6 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
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LCN10Q6JVE6 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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LCN10Q6JVE6 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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LCN10Q6JVE6 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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LCN10Q6JVE6 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
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LCN10Q6JVE6 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
LCN10Q6JVE6 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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LCN10Q6JVE6 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
LCN10Q6JVE6 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LCN10Q6JVE6 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LCN10Q6JVE6 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LCN10Q6JVE6 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LCN10Q6JVE6 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LCN10Q6JVE6 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LCN10Q6JVE6 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LCN10Q6JVE6 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
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