Protein–RNA interactions for Protein: Q6IQ19

CCSAP, Centriole, cilia and spindle-associated protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAPQ6IQ19 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCSAPQ6IQ19 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCSAPQ6IQ19 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
CCSAPQ6IQ19 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCSAPQ6IQ19 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCSAPQ6IQ19 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCSAPQ6IQ19 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCSAPQ6IQ19 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCSAPQ6IQ19 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCSAPQ6IQ19 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCSAPQ6IQ19 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCSAPQ6IQ19 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCSAPQ6IQ19 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCSAPQ6IQ19 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCSAPQ6IQ19 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
CCSAPQ6IQ19 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCSAPQ6IQ19 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCSAPQ6IQ19 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCSAPQ6IQ19 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
CCSAPQ6IQ19 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
CCSAPQ6IQ19 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCSAPQ6IQ19 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCSAPQ6IQ19 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCSAPQ6IQ19 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCSAPQ6IQ19 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
CCSAPQ6IQ19 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CCSAPQ6IQ19 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CCSAPQ6IQ19 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CCSAPQ6IQ19 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CCSAPQ6IQ19 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CCSAPQ6IQ19 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CCSAPQ6IQ19 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CCSAPQ6IQ19 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CCSAPQ6IQ19 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CCSAPQ6IQ19 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CCSAPQ6IQ19 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
CCSAPQ6IQ19 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CCSAPQ6IQ19 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CCSAPQ6IQ19 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CCSAPQ6IQ19 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CCSAPQ6IQ19 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
CCSAPQ6IQ19 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CCSAPQ6IQ19 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
CCSAPQ6IQ19 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CCSAPQ6IQ19 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CCSAPQ6IQ19 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CCSAPQ6IQ19 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CCSAPQ6IQ19 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CCSAPQ6IQ19 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CCSAPQ6IQ19 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CCSAPQ6IQ19 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CCSAPQ6IQ19 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CCSAPQ6IQ19 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CCSAPQ6IQ19 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CCSAPQ6IQ19 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CCSAPQ6IQ19 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CCSAPQ6IQ19 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CCSAPQ6IQ19 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CCSAPQ6IQ19 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CCSAPQ6IQ19 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CCSAPQ6IQ19 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CCSAPQ6IQ19 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CCSAPQ6IQ19 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
CCSAPQ6IQ19 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CCSAPQ6IQ19 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CCSAPQ6IQ19 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CCSAPQ6IQ19 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CCSAPQ6IQ19 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CCSAPQ6IQ19 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CCSAPQ6IQ19 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CCSAPQ6IQ19 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CCSAPQ6IQ19 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
CCSAPQ6IQ19 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
CCSAPQ6IQ19 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CCSAPQ6IQ19 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CCSAPQ6IQ19 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CCSAPQ6IQ19 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CCSAPQ6IQ19 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CCSAPQ6IQ19 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CCSAPQ6IQ19 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CCSAPQ6IQ19 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CCSAPQ6IQ19 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CCSAPQ6IQ19 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CCSAPQ6IQ19 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
CCSAPQ6IQ19 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CCSAPQ6IQ19 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CCSAPQ6IQ19 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CCSAPQ6IQ19 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CCSAPQ6IQ19 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CCSAPQ6IQ19 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CCSAPQ6IQ19 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CCSAPQ6IQ19 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CCSAPQ6IQ19 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CCSAPQ6IQ19 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CCSAPQ6IQ19 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CCSAPQ6IQ19 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CCSAPQ6IQ19 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CCSAPQ6IQ19 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CCSAPQ6IQ19 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CCSAPQ6IQ19 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms