Protein–RNA interactions for Protein: Q62447

Ccnc, Cyclin-C, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcncQ62447 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CcncQ62447 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CcncQ62447 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CcncQ62447 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CcncQ62447 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CcncQ62447 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CcncQ62447 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CcncQ62447 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CcncQ62447 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CcncQ62447 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CcncQ62447 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CcncQ62447 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CcncQ62447 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CcncQ62447 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CcncQ62447 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CcncQ62447 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CcncQ62447 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CcncQ62447 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CcncQ62447 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CcncQ62447 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CcncQ62447 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CcncQ62447 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CcncQ62447 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CcncQ62447 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CcncQ62447 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CcncQ62447 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CcncQ62447 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CcncQ62447 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CcncQ62447 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CcncQ62447 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CcncQ62447 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CcncQ62447 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CcncQ62447 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CcncQ62447 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CcncQ62447 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CcncQ62447 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CcncQ62447 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CcncQ62447 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CcncQ62447 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CcncQ62447 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CcncQ62447 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CcncQ62447 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CcncQ62447 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CcncQ62447 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CcncQ62447 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CcncQ62447 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CcncQ62447 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CcncQ62447 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CcncQ62447 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CcncQ62447 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CcncQ62447 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CcncQ62447 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CcncQ62447 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CcncQ62447 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CcncQ62447 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CcncQ62447 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CcncQ62447 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CcncQ62447 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CcncQ62447 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CcncQ62447 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CcncQ62447 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CcncQ62447 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CcncQ62447 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CcncQ62447 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CcncQ62447 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CcncQ62447 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CcncQ62447 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CcncQ62447 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CcncQ62447 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CcncQ62447 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CcncQ62447 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CcncQ62447 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CcncQ62447 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CcncQ62447 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CcncQ62447 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CcncQ62447 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CcncQ62447 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CcncQ62447 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CcncQ62447 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CcncQ62447 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CcncQ62447 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CcncQ62447 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CcncQ62447 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CcncQ62447 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CcncQ62447 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CcncQ62447 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CcncQ62447 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CcncQ62447 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CcncQ62447 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CcncQ62447 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CcncQ62447 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CcncQ62447 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CcncQ62447 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CcncQ62447 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CcncQ62447 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CcncQ62447 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CcncQ62447 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CcncQ62447 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CcncQ62447 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CcncQ62447 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.3 ms