Protein–RNA interactions for Protein: Q5ZPR3

CD276, CD276 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD276Q5ZPR3 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CD276Q5ZPR3 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CD276Q5ZPR3 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CD276Q5ZPR3 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CD276Q5ZPR3 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CD276Q5ZPR3 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CD276Q5ZPR3 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CD276Q5ZPR3 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CD276Q5ZPR3 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CD276Q5ZPR3 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CD276Q5ZPR3 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CD276Q5ZPR3 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CD276Q5ZPR3 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CD276Q5ZPR3 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CD276Q5ZPR3 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CD276Q5ZPR3 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CD276Q5ZPR3 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CD276Q5ZPR3 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CD276Q5ZPR3 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CD276Q5ZPR3 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CD276Q5ZPR3 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CD276Q5ZPR3 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CD276Q5ZPR3 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CD276Q5ZPR3 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CD276Q5ZPR3 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CD276Q5ZPR3 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CD276Q5ZPR3 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CD276Q5ZPR3 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CD276Q5ZPR3 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CD276Q5ZPR3 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CD276Q5ZPR3 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CD276Q5ZPR3 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CD276Q5ZPR3 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CD276Q5ZPR3 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CD276Q5ZPR3 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CD276Q5ZPR3 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD276Q5ZPR3 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD276Q5ZPR3 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD276Q5ZPR3 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD276Q5ZPR3 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD276Q5ZPR3 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CD276Q5ZPR3 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD276Q5ZPR3 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD276Q5ZPR3 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD276Q5ZPR3 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD276Q5ZPR3 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD276Q5ZPR3 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD276Q5ZPR3 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD276Q5ZPR3 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD276Q5ZPR3 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD276Q5ZPR3 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD276Q5ZPR3 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD276Q5ZPR3 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD276Q5ZPR3 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD276Q5ZPR3 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD276Q5ZPR3 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD276Q5ZPR3 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD276Q5ZPR3 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD276Q5ZPR3 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD276Q5ZPR3 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD276Q5ZPR3 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD276Q5ZPR3 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD276Q5ZPR3 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD276Q5ZPR3 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD276Q5ZPR3 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD276Q5ZPR3 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD276Q5ZPR3 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD276Q5ZPR3 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD276Q5ZPR3 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD276Q5ZPR3 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD276Q5ZPR3 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD276Q5ZPR3 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CD276Q5ZPR3 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD276Q5ZPR3 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD276Q5ZPR3 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD276Q5ZPR3 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD276Q5ZPR3 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD276Q5ZPR3 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD276Q5ZPR3 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD276Q5ZPR3 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CD276Q5ZPR3 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD276Q5ZPR3 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CD276Q5ZPR3 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD276Q5ZPR3 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD276Q5ZPR3 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD276Q5ZPR3 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CD276Q5ZPR3 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD276Q5ZPR3 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CD276Q5ZPR3 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD276Q5ZPR3 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD276Q5ZPR3 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD276Q5ZPR3 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CD276Q5ZPR3 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD276Q5ZPR3 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD276Q5ZPR3 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD276Q5ZPR3 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD276Q5ZPR3 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD276Q5ZPR3 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD276Q5ZPR3 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD276Q5ZPR3 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms