Protein–RNA interactions for Protein: Q5BN46

C9orf116, UPF0691 protein C9orf116, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 136 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf116Q5BN46 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
C9orf116Q5BN46 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
C9orf116Q5BN46 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
C9orf116Q5BN46 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
C9orf116Q5BN46 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
C9orf116Q5BN46 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
C9orf116Q5BN46 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
C9orf116Q5BN46 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
C9orf116Q5BN46 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
C9orf116Q5BN46 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
C9orf116Q5BN46 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
C9orf116Q5BN46 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
C9orf116Q5BN46 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
C9orf116Q5BN46 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
C9orf116Q5BN46 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
C9orf116Q5BN46 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
C9orf116Q5BN46 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
C9orf116Q5BN46 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
C9orf116Q5BN46 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
C9orf116Q5BN46 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
C9orf116Q5BN46 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
C9orf116Q5BN46 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
C9orf116Q5BN46 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
C9orf116Q5BN46 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
C9orf116Q5BN46 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
C9orf116Q5BN46 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
C9orf116Q5BN46 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
C9orf116Q5BN46 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
C9orf116Q5BN46 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
C9orf116Q5BN46 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
C9orf116Q5BN46 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
C9orf116Q5BN46 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
C9orf116Q5BN46 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
C9orf116Q5BN46 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
C9orf116Q5BN46 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
C9orf116Q5BN46 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
C9orf116Q5BN46 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
C9orf116Q5BN46 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
C9orf116Q5BN46 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
C9orf116Q5BN46 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
C9orf116Q5BN46 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
C9orf116Q5BN46 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
C9orf116Q5BN46 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
C9orf116Q5BN46 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
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C9orf116Q5BN46 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
C9orf116Q5BN46 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
C9orf116Q5BN46 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
C9orf116Q5BN46 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
C9orf116Q5BN46 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
C9orf116Q5BN46 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
C9orf116Q5BN46 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
C9orf116Q5BN46 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
C9orf116Q5BN46 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
C9orf116Q5BN46 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
C9orf116Q5BN46 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
C9orf116Q5BN46 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
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C9orf116Q5BN46 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
C9orf116Q5BN46 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
C9orf116Q5BN46 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.5
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C9orf116Q5BN46 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
C9orf116Q5BN46 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
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C9orf116Q5BN46 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
C9orf116Q5BN46 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
C9orf116Q5BN46 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
C9orf116Q5BN46 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
C9orf116Q5BN46 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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C9orf116Q5BN46 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
C9orf116Q5BN46 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
C9orf116Q5BN46 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
C9orf116Q5BN46 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
C9orf116Q5BN46 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
C9orf116Q5BN46 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
C9orf116Q5BN46 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
C9orf116Q5BN46 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
C9orf116Q5BN46 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
C9orf116Q5BN46 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
C9orf116Q5BN46 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
C9orf116Q5BN46 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
C9orf116Q5BN46 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
C9orf116Q5BN46 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
C9orf116Q5BN46 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
C9orf116Q5BN46 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
C9orf116Q5BN46 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
C9orf116Q5BN46 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
C9orf116Q5BN46 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
C9orf116Q5BN46 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
C9orf116Q5BN46 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
C9orf116Q5BN46 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
C9orf116Q5BN46 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
C9orf116Q5BN46 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
C9orf116Q5BN46 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
C9orf116Q5BN46 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
C9orf116Q5BN46 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
C9orf116Q5BN46 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
C9orf116Q5BN46 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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