Protein–RNA interactions for Protein: Q3BBV0

NBPF1, Neuroblastoma breakpoint family member 1, humanhuman

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Length 1,214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF1Q3BBV0 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NBPF1Q3BBV0 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NBPF1Q3BBV0 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
NBPF1Q3BBV0 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
NBPF1Q3BBV0 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NBPF1Q3BBV0 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NBPF1Q3BBV0 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NBPF1Q3BBV0 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NBPF1Q3BBV0 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NBPF1Q3BBV0 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NBPF1Q3BBV0 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NBPF1Q3BBV0 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NBPF1Q3BBV0 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NBPF1Q3BBV0 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NBPF1Q3BBV0 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NBPF1Q3BBV0 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NBPF1Q3BBV0 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NBPF1Q3BBV0 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NBPF1Q3BBV0 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NBPF1Q3BBV0 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
NBPF1Q3BBV0 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NBPF1Q3BBV0 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
NBPF1Q3BBV0 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
NBPF1Q3BBV0 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NBPF1Q3BBV0 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
NBPF1Q3BBV0 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
NBPF1Q3BBV0 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
NBPF1Q3BBV0 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
NBPF1Q3BBV0 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
NBPF1Q3BBV0 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
NBPF1Q3BBV0 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
NBPF1Q3BBV0 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
NBPF1Q3BBV0 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
NBPF1Q3BBV0 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NBPF1Q3BBV0 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NBPF1Q3BBV0 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NBPF1Q3BBV0 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NBPF1Q3BBV0 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NBPF1Q3BBV0 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NBPF1Q3BBV0 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NBPF1Q3BBV0 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NBPF1Q3BBV0 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NBPF1Q3BBV0 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
NBPF1Q3BBV0 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NBPF1Q3BBV0 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NBPF1Q3BBV0 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NBPF1Q3BBV0 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NBPF1Q3BBV0 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NBPF1Q3BBV0 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NBPF1Q3BBV0 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NBPF1Q3BBV0 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
NBPF1Q3BBV0 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NBPF1Q3BBV0 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NBPF1Q3BBV0 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NBPF1Q3BBV0 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
NBPF1Q3BBV0 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NBPF1Q3BBV0 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NBPF1Q3BBV0 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NBPF1Q3BBV0 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NBPF1Q3BBV0 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NBPF1Q3BBV0 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NBPF1Q3BBV0 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NBPF1Q3BBV0 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NBPF1Q3BBV0 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NBPF1Q3BBV0 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NBPF1Q3BBV0 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NBPF1Q3BBV0 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NBPF1Q3BBV0 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NBPF1Q3BBV0 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NBPF1Q3BBV0 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NBPF1Q3BBV0 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NBPF1Q3BBV0 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NBPF1Q3BBV0 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NBPF1Q3BBV0 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NBPF1Q3BBV0 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NBPF1Q3BBV0 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
NBPF1Q3BBV0 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NBPF1Q3BBV0 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NBPF1Q3BBV0 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NBPF1Q3BBV0 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NBPF1Q3BBV0 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NBPF1Q3BBV0 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NBPF1Q3BBV0 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NBPF1Q3BBV0 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NBPF1Q3BBV0 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NBPF1Q3BBV0 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NBPF1Q3BBV0 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NBPF1Q3BBV0 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NBPF1Q3BBV0 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NBPF1Q3BBV0 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NBPF1Q3BBV0 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NBPF1Q3BBV0 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NBPF1Q3BBV0 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NBPF1Q3BBV0 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NBPF1Q3BBV0 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NBPF1Q3BBV0 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
NBPF1Q3BBV0 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NBPF1Q3BBV0 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NBPF1Q3BBV0 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NBPF1Q3BBV0 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
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