Protein–RNA interactions for Protein: Q16831

UPP1, Uridine phosphorylase 1, humanhuman

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP1Q16831 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
UPP1Q16831 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
UPP1Q16831 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
UPP1Q16831 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
UPP1Q16831 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
UPP1Q16831 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
UPP1Q16831 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
UPP1Q16831 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
UPP1Q16831 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
UPP1Q16831 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
UPP1Q16831 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
UPP1Q16831 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
UPP1Q16831 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
UPP1Q16831 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
UPP1Q16831 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
UPP1Q16831 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
UPP1Q16831 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
UPP1Q16831 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
UPP1Q16831 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
UPP1Q16831 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
UPP1Q16831 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
UPP1Q16831 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
UPP1Q16831 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
UPP1Q16831 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
UPP1Q16831 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
UPP1Q16831 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
UPP1Q16831 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
UPP1Q16831 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
UPP1Q16831 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
UPP1Q16831 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
UPP1Q16831 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
UPP1Q16831 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
UPP1Q16831 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
UPP1Q16831 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
UPP1Q16831 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
UPP1Q16831 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
UPP1Q16831 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
UPP1Q16831 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
UPP1Q16831 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
UPP1Q16831 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
UPP1Q16831 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
UPP1Q16831 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
UPP1Q16831 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
UPP1Q16831 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
UPP1Q16831 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
UPP1Q16831 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
UPP1Q16831 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
UPP1Q16831 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
UPP1Q16831 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
UPP1Q16831 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
UPP1Q16831 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
UPP1Q16831 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
UPP1Q16831 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
UPP1Q16831 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
UPP1Q16831 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
UPP1Q16831 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
UPP1Q16831 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
UPP1Q16831 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
UPP1Q16831 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
UPP1Q16831 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
UPP1Q16831 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
UPP1Q16831 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
UPP1Q16831 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
UPP1Q16831 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
UPP1Q16831 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC19■□□□□ 0.63
UPP1Q16831 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
UPP1Q16831 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
UPP1Q16831 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
UPP1Q16831 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
UPP1Q16831 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
UPP1Q16831 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
UPP1Q16831 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
UPP1Q16831 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
UPP1Q16831 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
UPP1Q16831 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
UPP1Q16831 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC19■□□□□ 0.63
UPP1Q16831 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
UPP1Q16831 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
UPP1Q16831 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
UPP1Q16831 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
UPP1Q16831 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
UPP1Q16831 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
UPP1Q16831 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC19■□□□□ 0.63
UPP1Q16831 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
UPP1Q16831 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
UPP1Q16831 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
UPP1Q16831 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
UPP1Q16831 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
UPP1Q16831 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
UPP1Q16831 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
UPP1Q16831 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
UPP1Q16831 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
UPP1Q16831 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
UPP1Q16831 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
UPP1Q16831 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
UPP1Q16831 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
UPP1Q16831 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
UPP1Q16831 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
UPP1Q16831 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
UPP1Q16831 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms