Protein–RNA interactions for Protein: Q16342

PDCD2, Programmed cell death protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD2Q16342 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PDCD2Q16342 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PDCD2Q16342 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PDCD2Q16342 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PDCD2Q16342 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PDCD2Q16342 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PDCD2Q16342 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PDCD2Q16342 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PDCD2Q16342 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PDCD2Q16342 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PDCD2Q16342 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PDCD2Q16342 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PDCD2Q16342 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PDCD2Q16342 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PDCD2Q16342 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PDCD2Q16342 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PDCD2Q16342 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PDCD2Q16342 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PDCD2Q16342 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PDCD2Q16342 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PDCD2Q16342 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PDCD2Q16342 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PDCD2Q16342 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PDCD2Q16342 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PDCD2Q16342 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PDCD2Q16342 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PDCD2Q16342 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PDCD2Q16342 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PDCD2Q16342 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PDCD2Q16342 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PDCD2Q16342 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PDCD2Q16342 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PDCD2Q16342 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PDCD2Q16342 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PDCD2Q16342 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PDCD2Q16342 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PDCD2Q16342 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PDCD2Q16342 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PDCD2Q16342 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PDCD2Q16342 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PDCD2Q16342 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PDCD2Q16342 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PDCD2Q16342 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PDCD2Q16342 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PDCD2Q16342 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PDCD2Q16342 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PDCD2Q16342 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PDCD2Q16342 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
PDCD2Q16342 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
PDCD2Q16342 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PDCD2Q16342 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
PDCD2Q16342 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PDCD2Q16342 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PDCD2Q16342 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PDCD2Q16342 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
PDCD2Q16342 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
PDCD2Q16342 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PDCD2Q16342 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
PDCD2Q16342 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PDCD2Q16342 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PDCD2Q16342 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PDCD2Q16342 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PDCD2Q16342 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PDCD2Q16342 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PDCD2Q16342 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PDCD2Q16342 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
PDCD2Q16342 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
PDCD2Q16342 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
PDCD2Q16342 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PDCD2Q16342 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PDCD2Q16342 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PDCD2Q16342 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PDCD2Q16342 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PDCD2Q16342 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PDCD2Q16342 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PDCD2Q16342 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PDCD2Q16342 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PDCD2Q16342 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PDCD2Q16342 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PDCD2Q16342 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PDCD2Q16342 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
PDCD2Q16342 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PDCD2Q16342 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PDCD2Q16342 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PDCD2Q16342 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PDCD2Q16342 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PDCD2Q16342 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PDCD2Q16342 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PDCD2Q16342 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PDCD2Q16342 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PDCD2Q16342 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PDCD2Q16342 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PDCD2Q16342 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
PDCD2Q16342 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PDCD2Q16342 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PDCD2Q16342 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PDCD2Q16342 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PDCD2Q16342 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
PDCD2Q16342 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PDCD2Q16342 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms