Protein–RNA interactions for Protein: Q15818

NPTX1, Neuronal pentraxin-1, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPTX1Q15818 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
NPTX1Q15818 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NPTX1Q15818 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NPTX1Q15818 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NPTX1Q15818 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NPTX1Q15818 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NPTX1Q15818 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NPTX1Q15818 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NPTX1Q15818 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NPTX1Q15818 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NPTX1Q15818 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NPTX1Q15818 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NPTX1Q15818 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NPTX1Q15818 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NPTX1Q15818 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NPTX1Q15818 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NPTX1Q15818 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NPTX1Q15818 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NPTX1Q15818 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NPTX1Q15818 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NPTX1Q15818 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NPTX1Q15818 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NPTX1Q15818 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NPTX1Q15818 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NPTX1Q15818 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NPTX1Q15818 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NPTX1Q15818 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NPTX1Q15818 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NPTX1Q15818 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NPTX1Q15818 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NPTX1Q15818 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NPTX1Q15818 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NPTX1Q15818 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NPTX1Q15818 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NPTX1Q15818 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NPTX1Q15818 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NPTX1Q15818 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NPTX1Q15818 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NPTX1Q15818 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
NPTX1Q15818 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NPTX1Q15818 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NPTX1Q15818 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NPTX1Q15818 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NPTX1Q15818 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NPTX1Q15818 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NPTX1Q15818 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
NPTX1Q15818 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NPTX1Q15818 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NPTX1Q15818 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NPTX1Q15818 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NPTX1Q15818 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NPTX1Q15818 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NPTX1Q15818 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NPTX1Q15818 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NPTX1Q15818 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NPTX1Q15818 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NPTX1Q15818 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NPTX1Q15818 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NPTX1Q15818 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NPTX1Q15818 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NPTX1Q15818 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NPTX1Q15818 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NPTX1Q15818 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NPTX1Q15818 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NPTX1Q15818 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NPTX1Q15818 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NPTX1Q15818 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NPTX1Q15818 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
NPTX1Q15818 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NPTX1Q15818 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NPTX1Q15818 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
NPTX1Q15818 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NPTX1Q15818 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NPTX1Q15818 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NPTX1Q15818 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NPTX1Q15818 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NPTX1Q15818 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NPTX1Q15818 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NPTX1Q15818 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NPTX1Q15818 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NPTX1Q15818 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NPTX1Q15818 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NPTX1Q15818 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NPTX1Q15818 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NPTX1Q15818 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NPTX1Q15818 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NPTX1Q15818 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NPTX1Q15818 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NPTX1Q15818 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NPTX1Q15818 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NPTX1Q15818 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NPTX1Q15818 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
NPTX1Q15818 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NPTX1Q15818 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NPTX1Q15818 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NPTX1Q15818 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NPTX1Q15818 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NPTX1Q15818 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NPTX1Q15818 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NPTX1Q15818 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms