Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SIX1Q15475 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SIX1Q15475 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SIX1Q15475 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SIX1Q15475 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SIX1Q15475 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SIX1Q15475 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SIX1Q15475 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SIX1Q15475 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SIX1Q15475 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SIX1Q15475 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SIX1Q15475 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SIX1Q15475 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SIX1Q15475 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SIX1Q15475 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SIX1Q15475 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SIX1Q15475 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SIX1Q15475 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SIX1Q15475 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SIX1Q15475 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SIX1Q15475 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SIX1Q15475 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SIX1Q15475 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SIX1Q15475 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SIX1Q15475 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SIX1Q15475 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SIX1Q15475 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SIX1Q15475 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SIX1Q15475 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SIX1Q15475 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SIX1Q15475 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SIX1Q15475 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SIX1Q15475 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SIX1Q15475 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SIX1Q15475 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SIX1Q15475 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SIX1Q15475 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SIX1Q15475 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SIX1Q15475 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SIX1Q15475 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SIX1Q15475 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SIX1Q15475 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SIX1Q15475 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SIX1Q15475 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SIX1Q15475 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SIX1Q15475 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SIX1Q15475 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SIX1Q15475 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SIX1Q15475 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SIX1Q15475 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SIX1Q15475 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SIX1Q15475 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SIX1Q15475 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SIX1Q15475 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SIX1Q15475 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SIX1Q15475 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SIX1Q15475 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SIX1Q15475 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SIX1Q15475 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SIX1Q15475 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SIX1Q15475 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SIX1Q15475 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SIX1Q15475 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SIX1Q15475 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SIX1Q15475 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SIX1Q15475 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SIX1Q15475 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SIX1Q15475 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SIX1Q15475 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SIX1Q15475 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SIX1Q15475 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SIX1Q15475 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SIX1Q15475 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SIX1Q15475 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SIX1Q15475 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SIX1Q15475 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SIX1Q15475 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SIX1Q15475 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SIX1Q15475 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SIX1Q15475 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SIX1Q15475 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SIX1Q15475 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SIX1Q15475 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SIX1Q15475 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SIX1Q15475 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SIX1Q15475 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SIX1Q15475 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SIX1Q15475 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SIX1Q15475 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SIX1Q15475 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SIX1Q15475 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SIX1Q15475 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SIX1Q15475 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SIX1Q15475 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SIX1Q15475 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SIX1Q15475 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SIX1Q15475 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SIX1Q15475 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SIX1Q15475 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SIX1Q15475 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
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