Protein–RNA interactions for Protein: Q15270

NKX1-1, NK1 transcription factor-related protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-1Q15270 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
NKX1-1Q15270 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
NKX1-1Q15270 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NKX1-1Q15270 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NKX1-1Q15270 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NKX1-1Q15270 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
NKX1-1Q15270 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NKX1-1Q15270 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NKX1-1Q15270 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NKX1-1Q15270 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NKX1-1Q15270 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NKX1-1Q15270 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NKX1-1Q15270 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NKX1-1Q15270 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NKX1-1Q15270 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NKX1-1Q15270 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NKX1-1Q15270 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NKX1-1Q15270 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
NKX1-1Q15270 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NKX1-1Q15270 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NKX1-1Q15270 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
NKX1-1Q15270 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NKX1-1Q15270 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NKX1-1Q15270 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NKX1-1Q15270 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NKX1-1Q15270 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
NKX1-1Q15270 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
NKX1-1Q15270 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NKX1-1Q15270 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
NKX1-1Q15270 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NKX1-1Q15270 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NKX1-1Q15270 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NKX1-1Q15270 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NKX1-1Q15270 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NKX1-1Q15270 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NKX1-1Q15270 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NKX1-1Q15270 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NKX1-1Q15270 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NKX1-1Q15270 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NKX1-1Q15270 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NKX1-1Q15270 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NKX1-1Q15270 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NKX1-1Q15270 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NKX1-1Q15270 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NKX1-1Q15270 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NKX1-1Q15270 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NKX1-1Q15270 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NKX1-1Q15270 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NKX1-1Q15270 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NKX1-1Q15270 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NKX1-1Q15270 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NKX1-1Q15270 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
NKX1-1Q15270 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NKX1-1Q15270 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NKX1-1Q15270 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NKX1-1Q15270 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NKX1-1Q15270 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NKX1-1Q15270 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NKX1-1Q15270 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
NKX1-1Q15270 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NKX1-1Q15270 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NKX1-1Q15270 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NKX1-1Q15270 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NKX1-1Q15270 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NKX1-1Q15270 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NKX1-1Q15270 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
NKX1-1Q15270 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NKX1-1Q15270 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NKX1-1Q15270 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
NKX1-1Q15270 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NKX1-1Q15270 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NKX1-1Q15270 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NKX1-1Q15270 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NKX1-1Q15270 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NKX1-1Q15270 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NKX1-1Q15270 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
NKX1-1Q15270 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NKX1-1Q15270 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
NKX1-1Q15270 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NKX1-1Q15270 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NKX1-1Q15270 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NKX1-1Q15270 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NKX1-1Q15270 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NKX1-1Q15270 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NKX1-1Q15270 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NKX1-1Q15270 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NKX1-1Q15270 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NKX1-1Q15270 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NKX1-1Q15270 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NKX1-1Q15270 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NKX1-1Q15270 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NKX1-1Q15270 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NKX1-1Q15270 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NKX1-1Q15270 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NKX1-1Q15270 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
NKX1-1Q15270 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NKX1-1Q15270 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NKX1-1Q15270 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
NKX1-1Q15270 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NKX1-1Q15270 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
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