Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHD4Q14839 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHD4Q14839 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHD4Q14839 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHD4Q14839 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHD4Q14839 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHD4Q14839 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHD4Q14839 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHD4Q14839 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHD4Q14839 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHD4Q14839 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHD4Q14839 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHD4Q14839 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHD4Q14839 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CHD4Q14839 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHD4Q14839 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHD4Q14839 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CHD4Q14839 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHD4Q14839 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHD4Q14839 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CHD4Q14839 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHD4Q14839 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHD4Q14839 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
CHD4Q14839 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
CHD4Q14839 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHD4Q14839 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHD4Q14839 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHD4Q14839 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHD4Q14839 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHD4Q14839 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHD4Q14839 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHD4Q14839 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHD4Q14839 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHD4Q14839 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHD4Q14839 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHD4Q14839 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHD4Q14839 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHD4Q14839 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CHD4Q14839 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHD4Q14839 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHD4Q14839 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHD4Q14839 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHD4Q14839 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHD4Q14839 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHD4Q14839 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHD4Q14839 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHD4Q14839 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHD4Q14839 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHD4Q14839 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHD4Q14839 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHD4Q14839 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHD4Q14839 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHD4Q14839 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHD4Q14839 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHD4Q14839 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHD4Q14839 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHD4Q14839 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHD4Q14839 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHD4Q14839 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHD4Q14839 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHD4Q14839 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHD4Q14839 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHD4Q14839 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHD4Q14839 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHD4Q14839 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHD4Q14839 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHD4Q14839 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHD4Q14839 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHD4Q14839 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHD4Q14839 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHD4Q14839 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHD4Q14839 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CHD4Q14839 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHD4Q14839 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHD4Q14839 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHD4Q14839 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHD4Q14839 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHD4Q14839 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHD4Q14839 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHD4Q14839 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CHD4Q14839 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHD4Q14839 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CHD4Q14839 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHD4Q14839 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHD4Q14839 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHD4Q14839 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHD4Q14839 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHD4Q14839 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHD4Q14839 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHD4Q14839 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHD4Q14839 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHD4Q14839 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CHD4Q14839 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHD4Q14839 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CHD4Q14839 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHD4Q14839 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHD4Q14839 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHD4Q14839 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHD4Q14839 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHD4Q14839 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
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