Protein–RNA interactions for Protein: Q14563

SEMA3A, Semaphorin-3A, humanhuman

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Length 771 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3AQ14563 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SEMA3AQ14563 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SEMA3AQ14563 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SEMA3AQ14563 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SEMA3AQ14563 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SEMA3AQ14563 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SEMA3AQ14563 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SEMA3AQ14563 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SEMA3AQ14563 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SEMA3AQ14563 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SEMA3AQ14563 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SEMA3AQ14563 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SEMA3AQ14563 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SEMA3AQ14563 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SEMA3AQ14563 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SEMA3AQ14563 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SEMA3AQ14563 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SEMA3AQ14563 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SEMA3AQ14563 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SEMA3AQ14563 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SEMA3AQ14563 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SEMA3AQ14563 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SEMA3AQ14563 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SEMA3AQ14563 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SEMA3AQ14563 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SEMA3AQ14563 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SEMA3AQ14563 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SEMA3AQ14563 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SEMA3AQ14563 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SEMA3AQ14563 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SEMA3AQ14563 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SEMA3AQ14563 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SEMA3AQ14563 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SEMA3AQ14563 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SEMA3AQ14563 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SEMA3AQ14563 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SEMA3AQ14563 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SEMA3AQ14563 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SEMA3AQ14563 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SEMA3AQ14563 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SEMA3AQ14563 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SEMA3AQ14563 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SEMA3AQ14563 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SEMA3AQ14563 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SEMA3AQ14563 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SEMA3AQ14563 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SEMA3AQ14563 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SEMA3AQ14563 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SEMA3AQ14563 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SEMA3AQ14563 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SEMA3AQ14563 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
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SEMA3AQ14563 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
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SEMA3AQ14563 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SEMA3AQ14563 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SEMA3AQ14563 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SEMA3AQ14563 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SEMA3AQ14563 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SEMA3AQ14563 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SEMA3AQ14563 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SEMA3AQ14563 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SEMA3AQ14563 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SEMA3AQ14563 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SEMA3AQ14563 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SEMA3AQ14563 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SEMA3AQ14563 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SEMA3AQ14563 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SEMA3AQ14563 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SEMA3AQ14563 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SEMA3AQ14563 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SEMA3AQ14563 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SEMA3AQ14563 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SEMA3AQ14563 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SEMA3AQ14563 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SEMA3AQ14563 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SEMA3AQ14563 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SEMA3AQ14563 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SEMA3AQ14563 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SEMA3AQ14563 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SEMA3AQ14563 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SEMA3AQ14563 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SEMA3AQ14563 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SEMA3AQ14563 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SEMA3AQ14563 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SEMA3AQ14563 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SEMA3AQ14563 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SEMA3AQ14563 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SEMA3AQ14563 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SEMA3AQ14563 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SEMA3AQ14563 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SEMA3AQ14563 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SEMA3AQ14563 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SEMA3AQ14563 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SEMA3AQ14563 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SEMA3AQ14563 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SEMA3AQ14563 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
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